Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF1CQ15572 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF1CQ15572 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF1CQ15572 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF1CQ15572 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF1CQ15572 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF1CQ15572 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF1CQ15572 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF1CQ15572 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF1CQ15572 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF1CQ15572 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF1CQ15572 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF1CQ15572 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF1CQ15572 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF1CQ15572 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF1CQ15572 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF1CQ15572 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF1CQ15572 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF1CQ15572 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TAF1CQ15572 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TAF1CQ15572 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TAF1CQ15572 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TAF1CQ15572 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TAF1CQ15572 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TAF1CQ15572 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TAF1CQ15572 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TAF1CQ15572 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TAF1CQ15572 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TAF1CQ15572 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TAF1CQ15572 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TAF1CQ15572 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TAF1CQ15572 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TAF1CQ15572 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TAF1CQ15572 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TAF1CQ15572 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TAF1CQ15572 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TAF1CQ15572 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TAF1CQ15572 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAF1CQ15572 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAF1CQ15572 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAF1CQ15572 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAF1CQ15572 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAF1CQ15572 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAF1CQ15572 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAF1CQ15572 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAF1CQ15572 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAF1CQ15572 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAF1CQ15572 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAF1CQ15572 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
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