Protein–RNA interactions for Protein: Q12272

TPT1, tRNA 2'-phosphotransferase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TPT1Q12272 AVT2YEL064C 1443 nt2.64□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 SWC4YGR002C 1431 nt2.64□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 ARO80YDR421W 2853 nt2.63□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 YJL132WYJL132W 2253 nt2.63□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 UBX3YDL091C 1368 nt2.63□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 EAP1YKL204W 1899 nt2.63□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 YER091C-AYER091C-A 222 nt2.63□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 PRP38YGR075C 729 nt2.63□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 YKL162C-AYKL162C-A 153 nt2.63□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 ECM9YKR004C 1134 nt2.63□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 YLR257WYLR257W 966 nt2.63□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 YOL029CYOL029C 606 nt2.63□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 YPR203WYPR203W 309 nt2.63□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 TIM12YBR091C 330 nt2.63□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt2.63□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 PSY4YBL046W 1326 nt2.63□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 SHS1YDL225W 1656 nt2.63□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 CWH43YCR017C 2862 nt2.63□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 SRB4YER022W 2064 nt2.62□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 MRS2YOR334W 1413 nt2.62□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 SRC1YML034W 2505 nt2.62□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 YJL119CYJL119C 324 nt2.62□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 YJR087WYJR087W 351 nt2.62□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 MCR1YKL150W 909 nt2.62□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 CWC24YLR323C 780 nt2.62□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 RPS16AYMR143W 432 nt2.62□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 YNL057WYNL057W 333 nt2.62□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 RPL16BYNL069C 597 nt2.62□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 YBR062CYBR062C 543 nt2.62□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 TMA64YDR117C 1698 nt2.62□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 NET1YJL076W 3570 nt2.62□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 ARK1YNL020C 1917 nt2.62□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 JJJ2YJL162C 1752 nt2.61□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 MMS1YPR164W 4224 nt2.61□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 MAL33YBR297W 1407 nt2.61□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 RIX1YHR197W 2292 nt2.61□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 YCR075W-AYCR075W-A 228 nt2.61□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 TMA20YER007C-A 546 nt2.61□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 YHR213WYHR213W 597 nt2.61□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 YIL175WYIL175W 318 nt2.61□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 YJL222W-BYJL222W-B 138 nt2.61□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 TDA8YAL064C-A 381 nt2.61□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 MRPL20YKR085C 588 nt2.61□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 CDC123YLR215C 1083 nt2.61□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 YAR062WYAR062W 597 nt2.61□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 YMR010WYMR010W 1218 nt2.61□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 SEC14YMR079W 915 nt2.61□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 YNL043CYNL043C 321 nt2.61□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 RPL20BYOR312C 519 nt2.61□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 HUT1YPL244C 1020 nt2.61□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 SPT10YJL127C 1923 nt2.61□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 URB2YJR041C 3525 nt2.61□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 FRT2YAL028W 1587 nt2.61□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 JSN1YJR091C 3276 nt2.6□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 UTP15YMR093W 1542 nt2.6□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 YCR090CYCR090C 549 nt2.6□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt2.6□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 TDA2YER071C 381 nt2.6□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 COG2YGR120C 789 nt2.6□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 VPS63YLR261C 327 nt2.6□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 DSE4YNR067C 3354 nt2.6□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 PCK1YKR097W 1650 nt2.6□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 YNL193WYNL193W 1677 nt2.6□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 NCS2YNL119W 1482 nt2.59□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 DTD1YDL219W 453 nt2.59□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 snR9snR9 187 nt2.59□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 DAD1YDR016C 285 nt2.59□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 YDR018CYDR018C 1191 nt2.59□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 YDR115WYDR115W 318 nt2.59□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 FIN1YDR130C 876 nt2.59□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 YGR053CYGR053C 852 nt2.59□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 PEX18YHR160C 852 nt2.59□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 CKA1YIL035C 1119 nt2.59□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 SRP21YKL122C 504 nt2.59□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 VMA6YLR447C 1038 nt2.59□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 CSM4YPL200W 471 nt2.59□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 PIS1YPR113W 663 nt2.59□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 CHS2YBR038W 2892 nt2.59□□□□□ -1.99
TPT1Q12272 RAD2YGR258C 3096 nt2.59□□□□□ -2
TPT1Q12272 MFB1YDR219C 1398 nt2.59□□□□□ -2
TPT1Q12272 MED1YPR070W 1701 nt2.59□□□□□ -2
TPT1Q12272 YDR338CYDR338C 2088 nt2.59□□□□□ -2
TPT1Q12272 ATP22YDR350C 2055 nt2.59□□□□□ -2
TPT1Q12272 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt2.59□□□□□ -2
TPT1Q12272 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt2.59□□□□□ -2
TPT1Q12272 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt2.59□□□□□ -2
TPT1Q12272 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt2.59□□□□□ -2
TPT1Q12272 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt2.59□□□□□ -2
TPT1Q12272 YCL019WYCL019W 5313 nt2.59□□□□□ -2
TPT1Q12272 VHR1YIL056W 1923 nt2.58□□□□□ -2
TPT1Q12272 BIT61YJL058C 1632 nt2.58□□□□□ -2
TPT1Q12272 NOP4YPL043W 2058 nt2.58□□□□□ -2
TPT1Q12272 SLH1YGR271W 5904 nt2.58□□□□□ -2
TPT1Q12272 OCA6YDR067C 675 nt2.58□□□□□ -2
TPT1Q12272 NCB2YDR397C 441 nt2.58□□□□□ -2
TPT1Q12272 FAR7YFR008W 666 nt2.58□□□□□ -2
TPT1Q12272 RPS0AYGR214W 759 nt2.58□□□□□ -2
TPT1Q12272 YAP5YIR018W 738 nt2.58□□□□□ -2
TPT1Q12272 SFT1YKL006C-A 294 nt2.58□□□□□ -2
TPT1Q12272 CSI1YMR025W 888 nt2.58□□□□□ -2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 25.6 ms