Protein–RNA interactions for Protein: Q12221

PUF2, mRNA-binding protein PUF2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 1,075 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF2Q12221 LEE1YPL054W 906 nt3.29□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 BYE1YKL005C 1785 nt3.29□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 SEA4YBL104C 3117 nt3.29□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 SPA2YLL021W 4401 nt3.29□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 TOP1YOL006C 2310 nt3.28□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 ATG21YPL100W 1491 nt3.28□□□□□ -1.88 RIP-Chip
PUF2Q12221 SMC3YJL074C 3693 nt3.28□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 NSP1YJL041W 2472 nt3.28□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 PUG1YER185W 912 nt3.28□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 COX13YGL191W 390 nt3.28□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 YGR228WYGR228W 345 nt3.28□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 RPL17BYJL177W 555 nt3.28□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 ANB1YJR047C 474 nt3.28□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 YKL070WYKL070W 510 nt3.28□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 ENV10YLR065C 546 nt3.28□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 YLR171WYLR171W 390 nt3.28□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 ARC18YLR370C 537 nt3.28□□□□□ -1.88 RIP-Chip
PUF2Q12221 TOM22YNL131W 459 nt3.28□□□□□ -1.88 RIP-Chip
PUF2Q12221 ATG3YNR007C 933 nt3.28□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt3.28□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 ALG14YBR070C 714 nt3.28□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 YMR317WYMR317W 3423 nt3.28□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 URA2YJL130C 6645 nt3.28□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 MTR4YJL050W 3222 nt3.27□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 VPS9YML097C 1356 nt3.27□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 MET10YFR030W 3108 nt3.27□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 AEP1YMR064W 1557 nt3.27□□□□□ -1.89 RIP-Chip
PUF2Q12221 YDR149CYDR149C 708 nt3.27□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 PRM8YGL053W 714 nt3.27□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 RPL9AYGL147C 576 nt3.27□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 SAE2YGL175C 1038 nt3.27□□□□□ -1.89 RIP-Chip
PUF2Q12221 YHL026CYHL026C 948 nt3.27□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 YHR130CYHR130C 336 nt3.27□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 PIR1YKL164C 1026 nt3.27□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 YLL044WYLL044W 447 nt3.27□□□□□ -1.89 RIP-Chip
PUF2Q12221 snR42snR42 351 nt3.27□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 FUS2YMR232W 2034 nt3.27□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 ASI3YNL008C 2031 nt3.27□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 PSP1YDR505C 2526 nt3.27□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 VFA1YER128W 612 nt3.26□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 RPL30YGL030W 318 nt3.26□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 YIR036W-AYIR036W-A 402 nt3.26□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 LSM1YJL124C 519 nt3.26□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 VPS51YKR020W 495 nt3.26□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 YNR021WYNR021W 1215 nt3.26□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 SNU56YDR240C 1479 nt3.26□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 YDL176WYDL176W 2127 nt3.26□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 AVT2YEL064C 1443 nt3.26□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 CCM1YGR150C 2595 nt3.25□□□□□ -1.89 RIP-Chip
PUF2Q12221 TPO5YKL174C 1857 nt3.25□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 PSF1YDR013W 627 nt3.25□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 CHZ1YER030W 462 nt3.25□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 IES5YER092W 378 nt3.25□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 ASG7YJL170C 630 nt3.25□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 YKT6YKL196C 603 nt3.25□□□□□ -1.89 RIP-Chip
PUF2Q12221 RAD33YML011C 534 nt3.25□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 ERG2YMR202W 669 nt3.25□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 YNL058CYNL058C 951 nt3.25□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 AAR2YBL074C 1068 nt3.25□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 DPB3YBR278W 606 nt3.25□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 VTC4YJL012C 2166 nt3.25□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 ETP1YHL010C 1758 nt3.25□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 FAS1YKL182W 6156 nt3.25□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 AVT5YBL089W 1380 nt3.25□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 DNM1YLL001W 2274 nt3.24□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 YDR320W-BYDR320W-B 138 nt3.24□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt3.24□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt3.24□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 HLR1YDR528W 1272 nt3.24□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 SPT4YGR063C 309 nt3.24□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 SPO13YHR014W 876 nt3.24□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 IRC19YLL033W 693 nt3.24□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 YLR297WYLR297W 390 nt3.24□□□□□ -1.89 RIP-Chip
PUF2Q12221 YMR173W-AYMR173W-A 1185 nt3.24□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 PAI3YMR174C 207 nt3.24□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt3.24□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 SRL1YOR247W 633 nt3.24□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 STE23YLR389C 3084 nt3.24□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 ARG2YJL071W 1725 nt3.24□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 MNT4YNR059W 1743 nt3.24□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 UBP16YPL072W 1500 nt3.24□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 RPN2YIL075C 2838 nt3.23□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 FAP7YDL166C 594 nt3.23□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 BNA7YDR428C 786 nt3.23□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 TDA2YER071C 381 nt3.23□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 YER119C-AYER119C-A 372 nt3.23□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt3.23□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt3.23□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 YOR029WYOR029W 336 nt3.23□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 YPR077CYPR077C 372 nt3.23□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 SEC66YBR171W 621 nt3.23□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 STU1YBL034C 4542 nt3.23□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 APC5YOR249C 2058 nt3.23□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 LST4YKL176C 2487 nt3.22□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 YNL284C-AYNL284C-A 1323 nt3.22□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 YGR237CYGR237C 2358 nt3.22□□□□□ -1.89 RIP-Chip
PUF2Q12221 ATP25YMR098C 1839 nt3.22□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 snR68snR68 136 nt3.22□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 MGT1YDL200C 567 nt3.22□□□□□ -1.89
PUF2Q12221 HTA1YDR225W 399 nt3.22□□□□□ -1.89 RIP-Chip
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