Protein–RNA interactions for Protein: P60412

KRTAP10-11, Keratin-associated protein 10-11, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP10-11P60412 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP10-11P60412 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms