Protein–RNA interactions for Protein: P54277

PMS1, PMS1 protein homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1P54277 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PMS1P54277 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PMS1P54277 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PMS1P54277 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PMS1P54277 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PMS1P54277 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PMS1P54277 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PMS1P54277 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PMS1P54277 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PMS1P54277 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PMS1P54277 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PMS1P54277 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PMS1P54277 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PMS1P54277 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PMS1P54277 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PMS1P54277 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PMS1P54277 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PMS1P54277 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PMS1P54277 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PMS1P54277 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PMS1P54277 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PMS1P54277 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PMS1P54277 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PMS1P54277 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PMS1P54277 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PMS1P54277 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PMS1P54277 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PMS1P54277 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PMS1P54277 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PMS1P54277 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PMS1P54277 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PMS1P54277 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PMS1P54277 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PMS1P54277 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PMS1P54277 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PMS1P54277 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PMS1P54277 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PMS1P54277 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PMS1P54277 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PMS1P54277 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PMS1P54277 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PMS1P54277 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PMS1P54277 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PMS1P54277 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PMS1P54277 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PMS1P54277 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PMS1P54277 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PMS1P54277 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PMS1P54277 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PMS1P54277 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PMS1P54277 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PMS1P54277 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PMS1P54277 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PMS1P54277 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PMS1P54277 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PMS1P54277 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PMS1P54277 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PMS1P54277 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PMS1P54277 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PMS1P54277 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PMS1P54277 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PMS1P54277 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PMS1P54277 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PMS1P54277 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PMS1P54277 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PMS1P54277 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PMS1P54277 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PMS1P54277 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PMS1P54277 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PMS1P54277 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PMS1P54277 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PMS1P54277 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PMS1P54277 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PMS1P54277 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PMS1P54277 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PMS1P54277 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PMS1P54277 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PMS1P54277 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PMS1P54277 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PMS1P54277 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PMS1P54277 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PMS1P54277 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PMS1P54277 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PMS1P54277 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PMS1P54277 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PMS1P54277 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PMS1P54277 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PMS1P54277 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PMS1P54277 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PMS1P54277 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PMS1P54277 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PMS1P54277 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PMS1P54277 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PMS1P54277 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PMS1P54277 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PMS1P54277 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PMS1P54277 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PMS1P54277 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PMS1P54277 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PMS1P54277 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms