Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SEC24CP53992 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms