Protein–RNA interactions for Protein: P52292

KPNA2, Importin subunit alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA2P52292 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KPNA2P52292 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
KPNA2P52292 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
KPNA2P52292 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
KPNA2P52292 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KPNA2P52292 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
KPNA2P52292 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KPNA2P52292 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
KPNA2P52292 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KPNA2P52292 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KPNA2P52292 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KPNA2P52292 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KPNA2P52292 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KPNA2P52292 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KPNA2P52292 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms