Protein–RNA interactions for Protein: P38176

AVT5, Vacuolar amino acid transporter 5, yeastyeast

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT5P38176 VMA8YEL051W 771 nt2.85□□□□□ -1.95
AVT5P38176 COX18YGR062C 951 nt2.85□□□□□ -1.95
AVT5P38176 YGR161W-CYGR161W-C 279 nt2.85□□□□□ -1.95
AVT5P38176 TMA19YKL056C 504 nt2.85□□□□□ -1.95
AVT5P38176 MRP49YKL167C 414 nt2.85□□□□□ -1.95
AVT5P38176 PHO80YOL001W 882 nt2.85□□□□□ -1.95
AVT5P38176 snR41snR41 95 nt2.85□□□□□ -1.95
AVT5P38176 RCY1YJL204C 2523 nt2.85□□□□□ -1.95
AVT5P38176 HRD1YOL013C 1656 nt2.85□□□□□ -1.95
AVT5P38176 SSL1YLR005W 1386 nt2.85□□□□□ -1.95
AVT5P38176 AIP1YMR092C 1848 nt2.84□□□□□ -1.95
AVT5P38176 AEP1YMR064W 1557 nt2.84□□□□□ -1.95
AVT5P38176 YDL050CYDL050C 372 nt2.84□□□□□ -1.95
AVT5P38176 HLR1YDR528W 1272 nt2.84□□□□□ -1.95
AVT5P38176 TDA2YER071C 381 nt2.84□□□□□ -1.95
AVT5P38176 LIF1YGL090W 1266 nt2.84□□□□□ -1.95
AVT5P38176 COX13YGL191W 390 nt2.84□□□□□ -1.95
AVT5P38176 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt2.84□□□□□ -1.95
AVT5P38176 RPL17BYJL177W 555 nt2.84□□□□□ -1.95
AVT5P38176 YKL069WYKL069W 543 nt2.84□□□□□ -1.95
AVT5P38176 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt2.84□□□□□ -1.95
AVT5P38176 AAR2YBL074C 1068 nt2.84□□□□□ -1.95
AVT5P38176 TIR2YOR010C 756 nt2.84□□□□□ -1.95
AVT5P38176 GCY1YOR120W 939 nt2.84□□□□□ -1.95
AVT5P38176 VTC4YJL012C 2166 nt2.84□□□□□ -1.96
AVT5P38176 ASI3YNL008C 2031 nt2.83□□□□□ -1.96
AVT5P38176 CDH1YGL003C 1701 nt2.83□□□□□ -1.96
AVT5P38176 CWC2YDL209C 1020 nt2.83□□□□□ -1.96
AVT5P38176 MFA1YDR461W 111 nt2.83□□□□□ -1.96
AVT5P38176 YFL015CYFL015C 495 nt2.83□□□□□ -1.96
AVT5P38176 RPS0AYGR214W 759 nt2.83□□□□□ -1.96
AVT5P38176 PAU13YHL046C 363 nt2.83□□□□□ -1.96
AVT5P38176 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt2.83□□□□□ -1.96
AVT5P38176 RPC37YKR025W 849 nt2.83□□□□□ -1.96
AVT5P38176 BER1YLR412W 825 nt2.83□□□□□ -1.96
AVT5P38176 YMR173W-AYMR173W-A 1185 nt2.83□□□□□ -1.96
AVT5P38176 GPI15YNL038W 690 nt2.83□□□□□ -1.96
AVT5P38176 ATG3YNR007C 933 nt2.83□□□□□ -1.96
AVT5P38176 YNR034W-AYNR034W-A 297 nt2.83□□□□□ -1.96
AVT5P38176 PEX11YOL147C 711 nt2.83□□□□□ -1.96
AVT5P38176 LEE1YPL054W 906 nt2.83□□□□□ -1.96
AVT5P38176 ALG14YBR070C 714 nt2.83□□□□□ -1.96
AVT5P38176 GIS4YML006C 2325 nt2.83□□□□□ -1.96
AVT5P38176 SKN7YHR206W 1869 nt2.83□□□□□ -1.96
AVT5P38176 FUS2YMR232W 2034 nt2.83□□□□□ -1.96
AVT5P38176 VIP1YLR410W 3441 nt2.83□□□□□ -1.96
AVT5P38176 MAK21YDR060W 3078 nt2.82□□□□□ -1.96
AVT5P38176 SKO1YNL167C 1944 nt2.82□□□□□ -1.96
AVT5P38176 IRC3YDR332W 2070 nt2.82□□□□□ -1.96
AVT5P38176 ARF1YDL192W 546 nt2.82□□□□□ -1.96
AVT5P38176 YDR320W-BYDR320W-B 138 nt2.82□□□□□ -1.96
AVT5P38176 AGA2YGL032C 264 nt2.82□□□□□ -1.96
AVT5P38176 YGR039WYGR039W 312 nt2.82□□□□□ -1.96
AVT5P38176 BCD1YHR040W 1101 nt2.82□□□□□ -1.96
AVT5P38176 SDO1YLR022C 753 nt2.82□□□□□ -1.96
AVT5P38176 RNH203YLR154C 333 nt2.82□□□□□ -1.96
AVT5P38176 PAI3YMR174C 207 nt2.82□□□□□ -1.96
AVT5P38176 YPR053CYPR053C 456 nt2.82□□□□□ -1.96
AVT5P38176 CMD1YBR109C 444 nt2.82□□□□□ -1.96
AVT5P38176 UBP16YPL072W 1500 nt2.82□□□□□ -1.96
AVT5P38176 SLA1YBL007C 3735 nt2.81□□□□□ -1.96
AVT5P38176 FUN30YAL019W 3396 nt2.81□□□□□ -1.96
AVT5P38176 STT4YLR305C 5703 nt2.81□□□□□ -1.96
AVT5P38176 YDR115WYDR115W 318 nt2.81□□□□□ -1.96
AVT5P38176 NTF2YER009W 378 nt2.81□□□□□ -1.96
AVT5P38176 FAR7YFR008W 666 nt2.81□□□□□ -1.96
AVT5P38176 RPL9AYGL147C 576 nt2.81□□□□□ -1.96
AVT5P38176 SPO13YHR014W 876 nt2.81□□□□□ -1.96
AVT5P38176 MRPL20YKR085C 588 nt2.81□□□□□ -1.96
AVT5P38176 IRC19YLL033W 693 nt2.81□□□□□ -1.96
AVT5P38176 ERG2YMR202W 669 nt2.81□□□□□ -1.96
AVT5P38176 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt2.81□□□□□ -1.96
AVT5P38176 RPL19AYBR084C-A 570 nt2.81□□□□□ -1.96
AVT5P38176 APC5YOR249C 2058 nt2.81□□□□□ -1.96
AVT5P38176 LST4YKL176C 2487 nt2.8□□□□□ -1.96
AVT5P38176 BEM4YPL161C 1902 nt2.8□□□□□ -1.96
AVT5P38176 CCT7YJL111W 1653 nt2.8□□□□□ -1.96
AVT5P38176 MGT1YDL200C 567 nt2.8□□□□□ -1.96
AVT5P38176 YER046W-AYER046W-A 330 nt2.8□□□□□ -1.96
AVT5P38176 ASG7YJL170C 630 nt2.8□□□□□ -1.96
AVT5P38176 YKL063CYKL063C 504 nt2.8□□□□□ -1.96
AVT5P38176 YKL156C-AYKL156C-A 117 nt2.8□□□□□ -1.96
AVT5P38176 ENV10YLR065C 546 nt2.8□□□□□ -1.96
AVT5P38176 YLR171WYLR171W 390 nt2.8□□□□□ -1.96
AVT5P38176 YKE2YLR200W 345 nt2.8□□□□□ -1.96
AVT5P38176 YNL150WYNL150W 408 nt2.8□□□□□ -1.96
AVT5P38176 GRE2YOL151W 1029 nt2.8□□□□□ -1.96
AVT5P38176 VAM10YOR068C 345 nt2.8□□□□□ -1.96
AVT5P38176 YPL107WYPL107W 747 nt2.8□□□□□ -1.96
AVT5P38176 YSP2YDR326C 4317 nt2.8□□□□□ -1.96
AVT5P38176 RPA135YPR010C 3612 nt2.8□□□□□ -1.96
AVT5P38176 YDL176WYDL176W 2127 nt2.8□□□□□ -1.96
AVT5P38176 SRB8YCR081W 4284 nt2.79□□□□□ -1.96
AVT5P38176 CIN1YOR349W 3045 nt2.79□□□□□ -1.96
AVT5P38176 RSC1YGR056W 2787 nt2.79□□□□□ -1.96
AVT5P38176 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt2.79□□□□□ -1.96
AVT5P38176 YNL284C-AYNL284C-A 1323 nt2.79□□□□□ -1.96
AVT5P38176 YDL032WYDL032W 312 nt2.79□□□□□ -1.96
AVT5P38176 AIM11YER093C-A 414 nt2.79□□□□□ -1.96
AVT5P38176 YHR130CYHR130C 336 nt2.79□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 35.8 ms