Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEFLP07196 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEFLP07196 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEFLP07196 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NEFLP07196 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEFLP07196 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEFLP07196 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEFLP07196 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEFLP07196 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEFLP07196 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEFLP07196 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEFLP07196 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEFLP07196 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEFLP07196 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEFLP07196 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEFLP07196 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEFLP07196 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEFLP07196 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NEFLP07196 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEFLP07196 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEFLP07196 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEFLP07196 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEFLP07196 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEFLP07196 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NEFLP07196 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEFLP07196 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEFLP07196 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEFLP07196 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEFLP07196 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEFLP07196 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEFLP07196 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEFLP07196 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEFLP07196 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEFLP07196 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEFLP07196 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEFLP07196 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEFLP07196 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEFLP07196 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEFLP07196 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEFLP07196 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEFLP07196 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEFLP07196 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NEFLP07196 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NEFLP07196 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEFLP07196 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEFLP07196 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEFLP07196 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEFLP07196 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEFLP07196 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEFLP07196 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEFLP07196 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NEFLP07196 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEFLP07196 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEFLP07196 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEFLP07196 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEFLP07196 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NEFLP07196 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEFLP07196 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEFLP07196 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEFLP07196 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEFLP07196 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEFLP07196 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NEFLP07196 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
NEFLP07196 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NEFLP07196 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NEFLP07196 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NEFLP07196 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NEFLP07196 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NEFLP07196 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NEFLP07196 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NEFLP07196 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NEFLP07196 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NEFLP07196 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NEFLP07196 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NEFLP07196 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEFLP07196 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEFLP07196 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEFLP07196 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEFLP07196 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEFLP07196 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEFLP07196 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEFLP07196 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEFLP07196 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEFLP07196 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEFLP07196 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEFLP07196 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEFLP07196 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEFLP07196 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
NEFLP07196 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEFLP07196 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NEFLP07196 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEFLP07196 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEFLP07196 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEFLP07196 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEFLP07196 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEFLP07196 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEFLP07196 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEFLP07196 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEFLP07196 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NEFLP07196 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms