Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
LRRC4BQ9NT99 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
LRRC4BQ9NT99 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC4BQ9NT99 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC4BQ9NT99 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC4BQ9NT99 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC4BQ9NT99 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC4BQ9NT99 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC4BQ9NT99 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC4BQ9NT99 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC4BQ9NT99 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC4BQ9NT99 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC4BQ9NT99 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC4BQ9NT99 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC4BQ9NT99 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC4BQ9NT99 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC4BQ9NT99 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC4BQ9NT99 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC4BQ9NT99 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC4BQ9NT99 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC4BQ9NT99 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC4BQ9NT99 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC4BQ9NT99 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC4BQ9NT99 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC4BQ9NT99 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC4BQ9NT99 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC4BQ9NT99 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC4BQ9NT99 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC4BQ9NT99 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC4BQ9NT99 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC4BQ9NT99 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC4BQ9NT99 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC4BQ9NT99 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC4BQ9NT99 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC4BQ9NT99 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC4BQ9NT99 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC4BQ9NT99 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC4BQ9NT99 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC4BQ9NT99 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC4BQ9NT99 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC4BQ9NT99 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC4BQ9NT99 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC4BQ9NT99 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC4BQ9NT99 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC4BQ9NT99 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC4BQ9NT99 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC4BQ9NT99 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC4BQ9NT99 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC4BQ9NT99 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC4BQ9NT99 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC4BQ9NT99 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC4BQ9NT99 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC4BQ9NT99 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC4BQ9NT99 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC4BQ9NT99 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC4BQ9NT99 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC4BQ9NT99 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC4BQ9NT99 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC4BQ9NT99 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC4BQ9NT99 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC4BQ9NT99 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC4BQ9NT99 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC4BQ9NT99 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC4BQ9NT99 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC4BQ9NT99 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC4BQ9NT99 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC4BQ9NT99 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC4BQ9NT99 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC4BQ9NT99 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC4BQ9NT99 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms