Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RIGQ13278 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIGQ13278 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIGQ13278 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIGQ13278 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIGQ13278 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIGQ13278 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RIGQ13278 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIGQ13278 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIGQ13278 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIGQ13278 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIGQ13278 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIGQ13278 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIGQ13278 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIGQ13278 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIGQ13278 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIGQ13278 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RIGQ13278 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIGQ13278 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIGQ13278 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIGQ13278 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIGQ13278 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIGQ13278 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RIGQ13278 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIGQ13278 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIGQ13278 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIGQ13278 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIGQ13278 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIGQ13278 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RIGQ13278 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIGQ13278 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIGQ13278 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIGQ13278 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIGQ13278 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RIGQ13278 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIGQ13278 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIGQ13278 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIGQ13278 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIGQ13278 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIGQ13278 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIGQ13278 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIGQ13278 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIGQ13278 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIGQ13278 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIGQ13278 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIGQ13278 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIGQ13278 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIGQ13278 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIGQ13278 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIGQ13278 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIGQ13278 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIGQ13278 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIGQ13278 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIGQ13278 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIGQ13278 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIGQ13278 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIGQ13278 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIGQ13278 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIGQ13278 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIGQ13278 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIGQ13278 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RIGQ13278 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIGQ13278 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIGQ13278 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIGQ13278 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIGQ13278 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIGQ13278 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIGQ13278 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIGQ13278 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIGQ13278 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIGQ13278 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIGQ13278 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIGQ13278 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIGQ13278 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIGQ13278 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIGQ13278 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIGQ13278 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIGQ13278 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIGQ13278 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RIGQ13278 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIGQ13278 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIGQ13278 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIGQ13278 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIGQ13278 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIGQ13278 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIGQ13278 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIGQ13278 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIGQ13278 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RIGQ13278 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIGQ13278 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIGQ13278 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIGQ13278 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIGQ13278 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIGQ13278 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIGQ13278 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIGQ13278 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIGQ13278 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIGQ13278 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIGQ13278 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RIGQ13278 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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