Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
GRIN2AQ12879 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
GRIN2AQ12879 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
GRIN2AQ12879 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
GRIN2AQ12879 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
GRIN2AQ12879 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
GRIN2AQ12879 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
GRIN2AQ12879 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
GRIN2AQ12879 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
GRIN2AQ12879 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
GRIN2AQ12879 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
GRIN2AQ12879 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
GRIN2AQ12879 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
GRIN2AQ12879 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
GRIN2AQ12879 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
GRIN2AQ12879 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
GRIN2AQ12879 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
GRIN2AQ12879 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
GRIN2AQ12879 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
GRIN2AQ12879 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
GRIN2AQ12879 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
GRIN2AQ12879 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
GRIN2AQ12879 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
GRIN2AQ12879 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
GRIN2AQ12879 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
GRIN2AQ12879 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
GRIN2AQ12879 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
GRIN2AQ12879 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
GRIN2AQ12879 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
GRIN2AQ12879 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
GRIN2AQ12879 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
GRIN2AQ12879 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
GRIN2AQ12879 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
GRIN2AQ12879 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
GRIN2AQ12879 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
GRIN2AQ12879 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC34.22■■■■□ 3.07
GRIN2AQ12879 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
GRIN2AQ12879 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
GRIN2AQ12879 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
GRIN2AQ12879 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
GRIN2AQ12879 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
GRIN2AQ12879 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
GRIN2AQ12879 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
GRIN2AQ12879 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
GRIN2AQ12879 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
GRIN2AQ12879 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
GRIN2AQ12879 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
GRIN2AQ12879 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
GRIN2AQ12879 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
GRIN2AQ12879 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
GRIN2AQ12879 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
GRIN2AQ12879 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
GRIN2AQ12879 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
GRIN2AQ12879 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
GRIN2AQ12879 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
GRIN2AQ12879 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
GRIN2AQ12879 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
GRIN2AQ12879 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
GRIN2AQ12879 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
GRIN2AQ12879 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
GRIN2AQ12879 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
GRIN2AQ12879 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
GRIN2AQ12879 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
GRIN2AQ12879 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
GRIN2AQ12879 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
GRIN2AQ12879 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
GRIN2AQ12879 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
GRIN2AQ12879 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
GRIN2AQ12879 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
GRIN2AQ12879 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
GRIN2AQ12879 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
GRIN2AQ12879 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
GRIN2AQ12879 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
GRIN2AQ12879 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
GRIN2AQ12879 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
GRIN2AQ12879 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
GRIN2AQ12879 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
GRIN2AQ12879 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
GRIN2AQ12879 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
GRIN2AQ12879 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
GRIN2AQ12879 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
GRIN2AQ12879 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
GRIN2AQ12879 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
GRIN2AQ12879 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
GRIN2AQ12879 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
GRIN2AQ12879 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
GRIN2AQ12879 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
GRIN2AQ12879 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
GRIN2AQ12879 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
GRIN2AQ12879 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
GRIN2AQ12879 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
GRIN2AQ12879 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
GRIN2AQ12879 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
GRIN2AQ12879 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
GRIN2AQ12879 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
GRIN2AQ12879 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
GRIN2AQ12879 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
GRIN2AQ12879 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
GRIN2AQ12879 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
GRIN2AQ12879 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
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