Protein–RNA interactions for Protein: Q12309

CLF1, Pre-mRNA-splicing factor CLF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 687 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLF1Q12309 YDR199WYDR199W 366 nt3.92□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 SAE2YGL175C 1038 nt3.92□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 NNF1YJR112W 606 nt3.92□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 YMR087WYMR087W 855 nt3.92□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 INN1YNL152W 1230 nt3.92□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 LEE1YPL054W 906 nt3.92□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 SUS1YBR111W-A 291 nt3.92□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 YDR089WYDR089W 2610 nt3.92□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 STP1YDR463W 1560 nt3.92□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 YOR022CYOR022C 2148 nt3.92□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 SEC27YGL137W 2670 nt3.92□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 PIN4YBL051C 2007 nt3.92□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 YBP2YGL060W 1926 nt3.91□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 SSM4YIL030C 3960 nt3.91□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 DAN4YJR151C 3486 nt3.91□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 YCR013CYCR013C 648 nt3.91□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 YDR464C-AYDR464C-A 189 nt3.91□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 YEL032C-AYEL032C-A 162 nt3.91□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 VFA1YER128W 612 nt3.91□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 SPO13YHR014W 876 nt3.91□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt3.91□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 RIM11YMR139W 1113 nt3.91□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 IGO1YNL157W 507 nt3.91□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 TIR2YOR010C 756 nt3.91□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 PRP22YER013W 3438 nt3.91□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 AFR1YDR085C 1863 nt3.9□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 NEL1YHR035W 1893 nt3.9□□□□□ -1.78
CLF1Q12309 BAR1YIL015W 1764 nt3.9□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 RRP42YDL111C 798 nt3.9□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 VPS74YDR372C 1038 nt3.9□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 FRQ1YDR373W 573 nt3.9□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 HLR1YDR528W 1272 nt3.9□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 RTR1YER139C 681 nt3.9□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 RGI2YIL057C 495 nt3.9□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 MRP49YKL167C 414 nt3.9□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 ILV5YLR355C 1188 nt3.9□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 TVP18YMR071C 504 nt3.9□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 GCY1YOR120W 939 nt3.9□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 MDN1YLR106C 14733 nt3.9□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 SPT6YGR116W 4356 nt3.9□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 SET1YHR119W 3243 nt3.9□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 ASI1YMR119W 1875 nt3.9□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 ECM11YDR446W 909 nt3.89□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 RPS8BYER102W 603 nt3.89□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 COX13YGL191W 390 nt3.89□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 YHR214C-EYHR214C-E 300 nt3.89□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 YKT6YKL196C 603 nt3.89□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 COQ9YLR201C 783 nt3.89□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 YAR070CYAR070C 300 nt3.89□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 ATP18YML081C-A 180 nt3.89□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 RPS8AYBL072C 603 nt3.89□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 ATG21YPL100W 1491 nt3.89□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 CHD1YER164W 4407 nt3.88□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 ARP4YJL081C 1470 nt3.88□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 YDR526CYDR526C 471 nt3.88□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 VMA8YEL051W 771 nt3.88□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 YIR036W-AYIR036W-A 402 nt3.88□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 RPL22AYLR061W 366 nt3.88□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 YLR400WYLR400W 474 nt3.88□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 ATG3YNR007C 933 nt3.88□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 FYV12YOR183W 390 nt3.88□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 YPR077CYPR077C 372 nt3.88□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 YMR018WYMR018W 1545 nt3.88□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 NSP1YJL041W 2472 nt3.88□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 SKN7YHR206W 1869 nt3.88□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 VHR1YIL056W 1923 nt3.87□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 RUD3YOR216C 1455 nt3.87□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt3.87□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt3.87□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt3.87□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt3.87□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt3.87□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt3.87□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt3.87□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 AGA2YGL032C 264 nt3.87□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt3.87□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 RAD14YMR201C 1116 nt3.87□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 RFC3YNL290W 1023 nt3.87□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 PHO80YOL001W 882 nt3.87□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 RAD26YJR035W 3258 nt3.86□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 YDR149CYDR149C 708 nt3.86□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 MFA1YDR461W 111 nt3.86□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 SPT2YER161C 1002 nt3.86□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 FAR7YFR008W 666 nt3.86□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 YFR010W-AYFR010W-A 189 nt3.86□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 YGR228WYGR228W 345 nt3.86□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 RPL17BYJL177W 555 nt3.86□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 YNR034W-AYNR034W-A 297 nt3.86□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 ALG14YBR070C 714 nt3.86□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 YKL075CYKL075C 1353 nt3.86□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 TOP1YOL006C 2310 nt3.86□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 OSH3YHR073W 2991 nt3.85□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 YDL032WYDL032W 312 nt3.85□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 PUG1YER185W 912 nt3.85□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 LSM1YJL124C 519 nt3.85□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 BER1YLR412W 825 nt3.85□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 RPL19BYBL027W 570 nt3.85□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 RHO5YNL180C 996 nt3.85□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 VAM10YOR068C 345 nt3.85□□□□□ -1.79
CLF1Q12309 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt3.85□□□□□ -1.79
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