Protein–RNA interactions for Protein: Q12221

PUF2, mRNA-binding protein PUF2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 1,075 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF2Q12221 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt3.35□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt3.35□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt3.35□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt3.35□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt3.35□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt3.35□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt3.35□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 TAM41YGR046W 1158 nt3.35□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 RPC37YKR025W 849 nt3.35□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 BUR2YLR226W 1188 nt3.35□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 SHH3YMR118C 591 nt3.35□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 SWS2YNL081C 432 nt3.35□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 YNL276CYNL276C 396 nt3.35□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 FYV12YOR183W 390 nt3.35□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 YOR203WYOR203W 354 nt3.35□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 YPL088WYPL088W 1029 nt3.35□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 RPA135YPR010C 3612 nt3.35□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 YGL140CYGL140C 3660 nt3.34□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 ERG11YHR007C 1593 nt3.34□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 VPS33YLR396C 2076 nt3.34□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 YDL032WYDL032W 312 nt3.34□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 YDR114CYDR114C 303 nt3.34□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt3.34□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt3.34□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt3.34□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt3.34□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 MET32YDR253C 576 nt3.34□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 AGA2YGL032C 264 nt3.34□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 BRR6YGL247W 594 nt3.34□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 YKL063CYKL063C 504 nt3.34□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 YET1YKL065C 621 nt3.34□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 CDC123YLR215C 1083 nt3.34□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 BET5YML077W 480 nt3.34□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 FYV5YCL058C 459 nt3.34□□□□□ -1.87
PUF2Q12221 YBP2YGL060W 1926 nt3.34□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 ZDS2YML109W 2829 nt3.34□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 YJR030CYJR030C 2238 nt3.34□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 KRI1YNL308C 1776 nt3.33□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 MDN1YLR106C 14733 nt3.33□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 MFA1YDR461W 111 nt3.33□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 SUS1YBR111W-A 291 nt3.33□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 RUD3YOR216C 1455 nt3.33□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 AFR1YDR085C 1863 nt3.33□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 PWP2YCR057C 2772 nt3.32□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 PEX1YKL197C 3132 nt3.32□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 YDR526CYDR526C 471 nt3.32□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 YEL032C-AYEL032C-A 162 nt3.32□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 CGR1YGL029W 363 nt3.32□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 RPL16AYIL133C 600 nt3.32□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 YJR037WYJR037W 384 nt3.32□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 YLR400WYLR400W 474 nt3.32□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 ATP18YML081C-A 180 nt3.32□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 APD1YBR151W 951 nt3.32□□□□□ -1.88 RIP-Chip
PUF2Q12221 RNT1YMR239C 1416 nt3.32□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 ALG8YOR067C 1734 nt3.32□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 NEL1YHR035W 1893 nt3.32□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 EBS1YDR206W 2655 nt3.32□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 MIP6YHR015W 1980 nt3.31□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 STP1YDR463W 1560 nt3.31□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 VMA8YEL051W 771 nt3.31□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 GOS1YHL031C 672 nt3.31□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 RRF1YHR038W 693 nt3.31□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 SDL1YIL167W 633 nt3.31□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 PBA1YLR199C 831 nt3.31□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 PHO80YOL001W 882 nt3.31□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 LDS2YOL047C 1071 nt3.31□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 KAP95YLR347C 2586 nt3.31□□□□□ -1.88 RIP-Chip
PUF2Q12221 PKH1YDR490C 2301 nt3.31□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 FRE4YNR060W 2160 nt3.31□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 NOP4YPL043W 2058 nt3.31□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 REC8YPR007C 2043 nt3.31□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 BAR1YIL015W 1764 nt3.3□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 STU2YLR045C 2667 nt3.3□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 YDR089WYDR089W 2610 nt3.3□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 ANR2YKL047W 1551 nt3.3□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 YDR431WYDR431W 312 nt3.3□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 YDR464C-AYDR464C-A 189 nt3.3□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 FAR7YFR008W 666 nt3.3□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 YJL119CYJL119C 324 nt3.3□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 MRP8YKL142W 660 nt3.3□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 NNT1YLR285W 786 nt3.3□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 BER1YLR412W 825 nt3.3□□□□□ -1.88 RIP-Chip
PUF2Q12221 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt3.3□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 RHO5YNL180C 996 nt3.3□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 VHR1YIL056W 1923 nt3.3□□□□□ -1.88 RIP-Chip
PUF2Q12221 ARG5,6YER069W 2592 nt3.3□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 RAD26YJR035W 3258 nt3.3□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 ARP4YJL081C 1470 nt3.29□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 PIN4YBL051C 2007 nt3.29□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 YDR008CYDR008C 351 nt3.29□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 FRQ1YDR373W 573 nt3.29□□□□□ -1.88 RIP-Chip
PUF2Q12221 NCB2YDR397C 441 nt3.29□□□□□ -1.88 RIP-Chip
PUF2Q12221 YER175W-AYER175W-A 165 nt3.29□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 YFL015CYFL015C 495 nt3.29□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 CDC26YFR036W 375 nt3.29□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 COX23YHR116W 456 nt3.29□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 YBL028CYBL028C 321 nt3.29□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt3.29□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 YNR034W-AYNR034W-A 297 nt3.29□□□□□ -1.88
PUF2Q12221 GCY1YOR120W 939 nt3.29□□□□□ -1.88
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