Protein–RNA interactions for Protein: Q06835

RDS3, Pre-mRNA-splicing factor RDS3, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RDS3Q06835 BCK1YJL095W 4437 nt2.05□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 BNI4YNL233W 2679 nt2.05□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 MUB1YMR100W 1863 nt2.05□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 EMP70YLR083C 2004 nt2.05□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 VAB2YEL005C 849 nt2.05□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 YER066C-AYER066C-A 501 nt2.05□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 YGL039WYGL039W 1047 nt2.05□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 PEF1YGR058W 1008 nt2.05□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 MRPL9YGR220C 810 nt2.05□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 EFG1YGR271C-A 702 nt2.05□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 YHL002C-AYHL002C-A 489 nt2.05□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 VMA10YHR039C-A 345 nt2.05□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 ATG27YJL178C 816 nt2.05□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 YKL070WYKL070W 510 nt2.05□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 YKL115CYKL115C 393 nt2.05□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 YLR076CYLR076C 423 nt2.05□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 MER1YNL210W 813 nt2.05□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 PEX27YOR193W 1131 nt2.05□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 RTT10YPL183C 3042 nt2.05□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 YDR061WYDR061W 1620 nt2.05□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 SPP382YLR424W 2127 nt2.05□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 PFF1YBR074W 2931 nt2.04□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt2.04□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 TFC4YGR047C 3078 nt2.04□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 YIR040CYIR040C 333 nt2.04□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 YLR297WYLR297W 390 nt2.04□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 YML037CYML037C 1023 nt2.04□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 YMR141CYMR141C 309 nt2.04□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 MPD2YOL088C 834 nt2.04□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 PEX1YKL197C 3132 nt2.04□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 SEA4YBL104C 3117 nt2.04□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 MAK5YBR142W 2322 nt2.03□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 YBR259WYBR259W 2067 nt2.03□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 ERG11YHR007C 1593 nt2.03□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 YMR018WYMR018W 1545 nt2.03□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 VPS38YLR360W 1320 nt2.03□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 RIM1YCR028C-A 408 nt2.03□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 CPR5YDR304C 678 nt2.03□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 YIL141WYIL141W 390 nt2.03□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 ATG10YLL042C 504 nt2.03□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt2.03□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt2.03□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt2.03□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt2.03□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 YPT6YLR262C 648 nt2.03□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 SUB1YMR039C 879 nt2.03□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 MGE1YOR232W 687 nt2.03□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 GRX5YPL059W 453 nt2.03□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 snR24snR24 89 nt2.03□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 SSE2YBR169C 2082 nt2.03□□□□□ -2.08
RDS3Q06835 RAX2YLR084C 3663 nt2.03□□□□□ -2.09
RDS3Q06835 VPS64YDR200C 1815 nt2.03□□□□□ -2.09
RDS3Q06835 URB2YJR041C 3525 nt2.03□□□□□ -2.09
RDS3Q06835 CWH41YGL027C 2502 nt2.02□□□□□ -2.09
RDS3Q06835 TIF4631YGR162W 2859 nt2.02□□□□□ -2.09
RDS3Q06835 YDR381C-AYDR381C-A 345 nt2.02□□□□□ -2.09
RDS3Q06835 EMI1YDR512C 564 nt2.02□□□□□ -2.09
RDS3Q06835 RRT13YER066W 558 nt2.02□□□□□ -2.09
RDS3Q06835 VFA1YER128W 612 nt2.02□□□□□ -2.09
RDS3Q06835 STE2YFL026W 1296 nt2.02□□□□□ -2.09
RDS3Q06835 VEL1YGL258W 621 nt2.02□□□□□ -2.09
RDS3Q06835 BTN2YGR142W 1233 nt2.02□□□□□ -2.09
RDS3Q06835 YJL169WYJL169W 369 nt2.02□□□□□ -2.09
RDS3Q06835 NDL1YLR254C 570 nt2.02□□□□□ -2.09
RDS3Q06835 SPR2YOR214C 711 nt2.02□□□□□ -2.09
RDS3Q06835 YPL276WYPL276W 438 nt2.02□□□□□ -2.09
RDS3Q06835 RXT2YBR095C 1293 nt2.02□□□□□ -2.09
RDS3Q06835 TOM70YNL121C 1854 nt2.02□□□□□ -2.09
RDS3Q06835 CIK1YMR198W 1785 nt2.02□□□□□ -2.09
RDS3Q06835 SQS1YNL224C 2304 nt2.02□□□□□ -2.09
RDS3Q06835 EAP1YKL204W 1899 nt2.01□□□□□ -2.09
RDS3Q06835 CEP3YMR168C 1827 nt2.01□□□□□ -2.09
RDS3Q06835 SRD1YCR018C 666 nt2.01□□□□□ -2.09
RDS3Q06835 SPO11YHL022C 1197 nt2.01□□□□□ -2.09
RDS3Q06835 YIL046W-AYIL046W-A 165 nt2.01□□□□□ -2.09
RDS3Q06835 YKL069WYKL069W 543 nt2.01□□□□□ -2.09
RDS3Q06835 SRL3YKR091W 741 nt2.01□□□□□ -2.09
RDS3Q06835 GIM5YML094W 492 nt2.01□□□□□ -2.09
RDS3Q06835 YBL065WYBL065W 345 nt2.01□□□□□ -2.09
RDS3Q06835 YOR385WYOR385W 873 nt2.01□□□□□ -2.09
RDS3Q06835 RPC40YPR110C 1008 nt2.01□□□□□ -2.09
RDS3Q06835 VAS1YGR094W 3315 nt2.01□□□□□ -2.09
RDS3Q06835 STP2YHR006W 1626 nt2.01□□□□□ -2.09
RDS3Q06835 CYR1YJL005W 6081 nt2.01□□□□□ -2.09
RDS3Q06835 DIA2YOR080W 2199 nt2□□□□□ -2.09
RDS3Q06835 YPP1YGR198W 2454 nt2□□□□□ -2.09
RDS3Q06835 CDH1YGL003C 1701 nt2□□□□□ -2.09
RDS3Q06835 KHA1YJL094C 2622 nt2□□□□□ -2.09
RDS3Q06835 snR70snR70 164 nt2□□□□□ -2.09
RDS3Q06835 YFR054CYFR054C 579 nt2□□□□□ -2.09
RDS3Q06835 DSE2YHR143W 978 nt2□□□□□ -2.09
RDS3Q06835 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2□□□□□ -2.09
RDS3Q06835 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2□□□□□ -2.09
RDS3Q06835 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2□□□□□ -2.09
RDS3Q06835 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2□□□□□ -2.09
RDS3Q06835 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2□□□□□ -2.09
RDS3Q06835 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2□□□□□ -2.09
RDS3Q06835 YJL156W-AYJL156W-A 222 nt2□□□□□ -2.09
RDS3Q06835 RPS28BYLR264W 204 nt2□□□□□ -2.09
RDS3Q06835 SME1YOR159C 285 nt2□□□□□ -2.09
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