Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LINC00205P59089 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms