Protein–RNA interactions for Protein: P54277

PMS1, PMS1 protein homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1P54277 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PMS1P54277 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PMS1P54277 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PMS1P54277 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PMS1P54277 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PMS1P54277 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PMS1P54277 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PMS1P54277 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PMS1P54277 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PMS1P54277 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PMS1P54277 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PMS1P54277 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PMS1P54277 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PMS1P54277 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PMS1P54277 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PMS1P54277 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PMS1P54277 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PMS1P54277 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PMS1P54277 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PMS1P54277 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PMS1P54277 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PMS1P54277 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PMS1P54277 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PMS1P54277 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PMS1P54277 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PMS1P54277 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PMS1P54277 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PMS1P54277 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PMS1P54277 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PMS1P54277 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PMS1P54277 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PMS1P54277 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PMS1P54277 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PMS1P54277 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PMS1P54277 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PMS1P54277 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PMS1P54277 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
PMS1P54277 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PMS1P54277 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PMS1P54277 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PMS1P54277 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PMS1P54277 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PMS1P54277 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PMS1P54277 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PMS1P54277 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PMS1P54277 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PMS1P54277 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PMS1P54277 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PMS1P54277 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PMS1P54277 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PMS1P54277 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PMS1P54277 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PMS1P54277 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PMS1P54277 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PMS1P54277 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PMS1P54277 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PMS1P54277 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PMS1P54277 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PMS1P54277 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PMS1P54277 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PMS1P54277 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PMS1P54277 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PMS1P54277 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PMS1P54277 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PMS1P54277 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PMS1P54277 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PMS1P54277 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PMS1P54277 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PMS1P54277 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PMS1P54277 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PMS1P54277 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PMS1P54277 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PMS1P54277 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PMS1P54277 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PMS1P54277 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PMS1P54277 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PMS1P54277 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PMS1P54277 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PMS1P54277 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PMS1P54277 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PMS1P54277 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PMS1P54277 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PMS1P54277 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PMS1P54277 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PMS1P54277 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PMS1P54277 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PMS1P54277 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PMS1P54277 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PMS1P54277 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PMS1P54277 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PMS1P54277 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PMS1P54277 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PMS1P54277 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PMS1P54277 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PMS1P54277 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PMS1P54277 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PMS1P54277 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PMS1P54277 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PMS1P54277 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PMS1P54277 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms