Protein–RNA interactions for Protein: P38316

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, yeast

Predictions only

Length 186 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG12	P38316	YBR300C	YBR300C	498 nt		2.55	□□□□□ -2
ATG12	P38316	YBR259W	YBR259W	2067 nt		2.54	□□□□□ -2
ATG12	P38316	SYS1	YJL004C	612 nt		2.54	□□□□□ -2
ATG12	P38316	UBC12	YLR306W	567 nt		2.54	□□□□□ -2
ATG12	P38316	CCW14	YLR390W-A	717 nt		2.54	□□□□□ -2
ATG12	P38316	LTP1	YPR073C	486 nt		2.54	□□□□□ -2
ATG12	P38316	CSH1	YBR161W	1131 nt		2.54	□□□□□ -2
ATG12	P38316	SRB8	YCR081W	4284 nt		2.54	□□□□□ -2
ATG12	P38316	PDR11	YIL013C	4236 nt		2.53	□□□□□ -2
ATG12	P38316	ARP8	YOR141C	2646 nt		2.53	□□□□□ -2
ATG12	P38316	PET100	YDR079W	336 nt		2.53	□□□□□ -2
ATG12	P38316	PEA2	YER149C	1263 nt		2.53	□□□□□ -2
ATG12	P38316	YFR032C-B	YFR032C-B	264 nt		2.53	□□□□□ -2
ATG12	P38316	YHR182C-A	YHR182C-A	474 nt		2.53	□□□□□ -2
ATG12	P38316	LSM8	YJR022W	330 nt		2.53	□□□□□ -2
ATG12	P38316	RPF2	YKR081C	1035 nt		2.53	□□□□□ -2
ATG12	P38316	RCE1	YMR274C	948 nt		2.53	□□□□□ -2
ATG12	P38316	YOR055W	YOR055W	435 nt		2.53	□□□□□ -2
ATG12	P38316	SWD3	YBR175W	948 nt		2.53	□□□□□ -2
ATG12	P38316	YKL100C	YKL100C	1764 nt		2.53	□□□□□ -2
ATG12	P38316	STE11	YLR362W	2154 nt		2.53	□□□□□ -2
ATG12	P38316	MRD1	YPR112C	2664 nt		2.52	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	YNR066C	YNR066C	1311 nt		2.52	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	KEL2	YGR238C	2649 nt		2.52	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	POL4	YCR014C	1749 nt		2.52	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	MED1	YPR070W	1701 nt		2.52	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	UBC9	YDL064W	474 nt		2.52	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	AI3	Q0060	1248 nt		2.52	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	COB	Q0105	1158 nt		2.52	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	MRPL9	YGR220C	810 nt		2.52	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	YHR052W-A	YHR052W-A	195 nt		2.52	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	YHR054W-A	YHR054W-A	195 nt		2.52	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	NNF1	YJR112W	606 nt		2.52	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	YBL062W	YBL062W	381 nt		2.52	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	TSR4	YOL022C	1227 nt		2.52	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	PEX15	YOL044W	1152 nt		2.52	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	PEX34	YCL056C	435 nt		2.52	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	SAP1	YER047C	2694 nt		2.52	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	SLH1	YGR271W	5904 nt		2.52	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	YDR061W	YDR061W	1620 nt		2.51	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	REV3	YPL167C	4515 nt		2.51	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	SKO1	YNL167C	1944 nt		2.51	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	RPL13A	YDL082W	600 nt		2.51	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	DIG2	YDR480W	972 nt		2.51	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	ERG28	YER044C	447 nt		2.51	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	YHR086W-A	YHR086W-A	162 nt		2.51	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	YLR163W-A	YLR163W-A	114 nt		2.51	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	YMR099C	YMR099C	894 nt		2.51	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	END3	YNL084C	1050 nt		2.51	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	YOL107W	YOL107W	1029 nt		2.51	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	CCL1	YPR025C	1182 nt		2.51	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	SHG1	YBR258C	429 nt		2.51	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	KAR4	YCL055W	1008 nt		2.51	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	SCP160	YJL080C	3669 nt		2.5	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	PUF6	YDR496C	1971 nt		2.5	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	YNL011C	YNL011C	1335 nt		2.5	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	PEX6	YNL329C	3093 nt		2.5	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	HMO1	YDR174W	741 nt		2.5	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	GET1	YGL020C	708 nt		2.5	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	ARG3	YJL088W	1017 nt		2.5	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	NDL1	YLR254C	570 nt		2.5	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	PML39	YML107C	1005 nt		2.5	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	FMP41	YNL168C	780 nt		2.5	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	YNL203C	YNL203C	612 nt		2.5	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	PNO1	YOR145C	825 nt		2.5	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	IRC13	YOR235W	315 nt		2.5	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	SRL1	YOR247W	633 nt		2.5	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	SMC6	YLR383W	3345 nt		2.5	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	SYO1	YDL063C	1863 nt		2.5	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	DSE4	YNR067C	3354 nt		2.49	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	NET1	YJL076W	3570 nt		2.49	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	YDL157C	YDL157C	357 nt		2.49	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	PLP1	YDR183W	693 nt		2.49	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	YPR1	YDR368W	939 nt		2.49	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	MEI4	YER044C-A	1227 nt		2.49	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	UPF3	YGR072W	1164 nt		2.49	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	AIM23	YJL131C	1071 nt		2.49	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	CPR7	YJR032W	1182 nt		2.49	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	YAL037W	YAL037W	804 nt		2.49	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	DAD2	YKR083C	402 nt		2.49	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	ERV41	YML067C	1059 nt		2.49	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	SUB1	YMR039C	879 nt		2.49	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	YMR187C	YMR187C	1296 nt		2.49	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	YNL319W	YNL319W	441 nt		2.49	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	DCP1	YOL149W	696 nt		2.49	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	LCL1	YPL056C	306 nt		2.49	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	PEX5	YDR244W	1839 nt		2.49	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	KHA1	YJL094C	2622 nt		2.49	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	MET6	YER091C	2304 nt		2.48	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	VHR2	YER064C	1518 nt		2.48	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	NDT80	YHR124W	1884 nt		2.48	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	URB2	YJR041C	3525 nt		2.48	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	YGL177W	YGL177W	348 nt		2.48	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	HTD2	YHR067W	843 nt		2.48	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	AYR1	YIL124W	894 nt		2.48	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	MRPL38	YKL170W	417 nt		2.48	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	GSP1	YLR293C	660 nt		2.48	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	VMA6	YLR447C	1038 nt		2.48	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	SSU72	YNL222W	621 nt		2.48	□□□□□ -2.01
ATG12	P38316	YPR027C	YPR027C	834 nt		2.48	□□□□□ -2.01

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.8 ms