Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ATP8A1Q9Y2Q0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATP8A1Q9Y2Q0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms