Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXD3Q9UJU5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXD3Q9UJU5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXD3Q9UJU5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXD3Q9UJU5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXD3Q9UJU5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXD3Q9UJU5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXD3Q9UJU5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXD3Q9UJU5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXD3Q9UJU5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXD3Q9UJU5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXD3Q9UJU5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXD3Q9UJU5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXD3Q9UJU5 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXD3Q9UJU5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXD3Q9UJU5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXD3Q9UJU5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXD3Q9UJU5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXD3Q9UJU5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXD3Q9UJU5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXD3Q9UJU5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXD3Q9UJU5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXD3Q9UJU5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXD3Q9UJU5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXD3Q9UJU5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXD3Q9UJU5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXD3Q9UJU5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXD3Q9UJU5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXD3Q9UJU5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXD3Q9UJU5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXD3Q9UJU5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXD3Q9UJU5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXD3Q9UJU5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXD3Q9UJU5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXD3Q9UJU5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXD3Q9UJU5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXD3Q9UJU5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXD3Q9UJU5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXD3Q9UJU5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD3Q9UJU5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.9 ms