Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CGGBP1Q9UFW8 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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