Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM106CQ9BVX2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM106CQ9BVX2 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms