Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSV6

TSEN34, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen34, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSEN34Q9BSV6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSEN34Q9BSV6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSEN34Q9BSV6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSEN34Q9BSV6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSEN34Q9BSV6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSEN34Q9BSV6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSEN34Q9BSV6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSEN34Q9BSV6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSEN34Q9BSV6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSEN34Q9BSV6 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TSEN34Q9BSV6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSEN34Q9BSV6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TSEN34Q9BSV6 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSEN34Q9BSV6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSEN34Q9BSV6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSEN34Q9BSV6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSEN34Q9BSV6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSEN34Q9BSV6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSEN34Q9BSV6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSEN34Q9BSV6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSEN34Q9BSV6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSEN34Q9BSV6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSEN34Q9BSV6 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSEN34Q9BSV6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSEN34Q9BSV6 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSEN34Q9BSV6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSEN34Q9BSV6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSEN34Q9BSV6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSEN34Q9BSV6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSEN34Q9BSV6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSEN34Q9BSV6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSEN34Q9BSV6 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TSEN34Q9BSV6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TSEN34Q9BSV6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSEN34Q9BSV6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSEN34Q9BSV6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSEN34Q9BSV6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSEN34Q9BSV6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSEN34Q9BSV6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSEN34Q9BSV6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSEN34Q9BSV6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TSEN34Q9BSV6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSEN34Q9BSV6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSEN34Q9BSV6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSEN34Q9BSV6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSEN34Q9BSV6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSEN34Q9BSV6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSEN34Q9BSV6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSEN34Q9BSV6 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSEN34Q9BSV6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSEN34Q9BSV6 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSEN34Q9BSV6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSEN34Q9BSV6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSEN34Q9BSV6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSEN34Q9BSV6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSEN34Q9BSV6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSEN34Q9BSV6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSEN34Q9BSV6 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSEN34Q9BSV6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSEN34Q9BSV6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSEN34Q9BSV6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSEN34Q9BSV6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSEN34Q9BSV6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSEN34Q9BSV6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSEN34Q9BSV6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSEN34Q9BSV6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSEN34Q9BSV6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSEN34Q9BSV6 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSEN34Q9BSV6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSEN34Q9BSV6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSEN34Q9BSV6 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSEN34Q9BSV6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSEN34Q9BSV6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSEN34Q9BSV6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSEN34Q9BSV6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSEN34Q9BSV6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSEN34Q9BSV6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSEN34Q9BSV6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSEN34Q9BSV6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSEN34Q9BSV6 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSEN34Q9BSV6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSEN34Q9BSV6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSEN34Q9BSV6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSEN34Q9BSV6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSEN34Q9BSV6 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSEN34Q9BSV6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSEN34Q9BSV6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSEN34Q9BSV6 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSEN34Q9BSV6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSEN34Q9BSV6 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSEN34Q9BSV6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSEN34Q9BSV6 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TSEN34Q9BSV6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSEN34Q9BSV6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSEN34Q9BSV6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSEN34Q9BSV6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSEN34Q9BSV6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSEN34Q9BSV6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSEN34Q9BSV6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSEN34Q9BSV6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms