Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SIRT1Q96EB6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SIRT1Q96EB6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SIRT1Q96EB6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SIRT1Q96EB6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SIRT1Q96EB6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SIRT1Q96EB6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SIRT1Q96EB6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
SIRT1Q96EB6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SIRT1Q96EB6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SIRT1Q96EB6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
SIRT1Q96EB6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SIRT1Q96EB6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SIRT1Q96EB6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SIRT1Q96EB6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SIRT1Q96EB6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SIRT1Q96EB6 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SIRT1Q96EB6 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SIRT1Q96EB6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SIRT1Q96EB6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SIRT1Q96EB6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SIRT1Q96EB6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SIRT1Q96EB6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SIRT1Q96EB6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SIRT1Q96EB6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SIRT1Q96EB6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SIRT1Q96EB6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SIRT1Q96EB6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
SIRT1Q96EB6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SIRT1Q96EB6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SIRT1Q96EB6 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SIRT1Q96EB6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SIRT1Q96EB6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SIRT1Q96EB6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SIRT1Q96EB6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SIRT1Q96EB6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SIRT1Q96EB6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SIRT1Q96EB6 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SIRT1Q96EB6 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SIRT1Q96EB6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SIRT1Q96EB6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SIRT1Q96EB6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SIRT1Q96EB6 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
SIRT1Q96EB6 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SIRT1Q96EB6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SIRT1Q96EB6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SIRT1Q96EB6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SIRT1Q96EB6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SIRT1Q96EB6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SIRT1Q96EB6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SIRT1Q96EB6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SIRT1Q96EB6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SIRT1Q96EB6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SIRT1Q96EB6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SIRT1Q96EB6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SIRT1Q96EB6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SIRT1Q96EB6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SIRT1Q96EB6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
SIRT1Q96EB6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SIRT1Q96EB6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SIRT1Q96EB6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SIRT1Q96EB6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SIRT1Q96EB6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SIRT1Q96EB6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SIRT1Q96EB6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SIRT1Q96EB6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SIRT1Q96EB6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SIRT1Q96EB6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SIRT1Q96EB6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SIRT1Q96EB6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SIRT1Q96EB6 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SIRT1Q96EB6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SIRT1Q96EB6 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SIRT1Q96EB6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SIRT1Q96EB6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SIRT1Q96EB6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SIRT1Q96EB6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SIRT1Q96EB6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SIRT1Q96EB6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SIRT1Q96EB6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SIRT1Q96EB6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
SIRT1Q96EB6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SIRT1Q96EB6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SIRT1Q96EB6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SIRT1Q96EB6 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SIRT1Q96EB6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SIRT1Q96EB6 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SIRT1Q96EB6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SIRT1Q96EB6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SIRT1Q96EB6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SIRT1Q96EB6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SIRT1Q96EB6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SIRT1Q96EB6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SIRT1Q96EB6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SIRT1Q96EB6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SIRT1Q96EB6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SIRT1Q96EB6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SIRT1Q96EB6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SIRT1Q96EB6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SIRT1Q96EB6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms