Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYNE4Q8N205 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYNE4Q8N205 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYNE4Q8N205 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYNE4Q8N205 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYNE4Q8N205 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYNE4Q8N205 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYNE4Q8N205 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYNE4Q8N205 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYNE4Q8N205 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYNE4Q8N205 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYNE4Q8N205 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYNE4Q8N205 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYNE4Q8N205 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYNE4Q8N205 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms