Protein–RNA interactions for Protein: Q15797

SMAD1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1Q15797 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMAD1Q15797 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD1Q15797 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD1Q15797 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD1Q15797 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD1Q15797 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD1Q15797 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD1Q15797 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD1Q15797 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD1Q15797 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD1Q15797 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD1Q15797 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD1Q15797 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD1Q15797 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD1Q15797 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD1Q15797 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD1Q15797 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMAD1Q15797 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD1Q15797 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD1Q15797 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD1Q15797 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD1Q15797 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD1Q15797 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD1Q15797 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD1Q15797 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD1Q15797 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD1Q15797 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD1Q15797 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD1Q15797 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD1Q15797 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD1Q15797 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD1Q15797 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD1Q15797 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD1Q15797 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMAD1Q15797 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD1Q15797 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD1Q15797 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD1Q15797 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD1Q15797 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD1Q15797 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD1Q15797 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD1Q15797 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD1Q15797 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD1Q15797 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD1Q15797 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD1Q15797 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD1Q15797 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD1Q15797 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD1Q15797 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD1Q15797 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD1Q15797 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD1Q15797 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMAD1Q15797 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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