Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
GRIN2AQ12879 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
GRIN2AQ12879 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
GRIN2AQ12879 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
GRIN2AQ12879 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
GRIN2AQ12879 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
GRIN2AQ12879 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
GRIN2AQ12879 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
GRIN2AQ12879 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
GRIN2AQ12879 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
GRIN2AQ12879 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC34.35■■■■□ 3.09
GRIN2AQ12879 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
GRIN2AQ12879 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
GRIN2AQ12879 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
GRIN2AQ12879 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
GRIN2AQ12879 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
GRIN2AQ12879 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
GRIN2AQ12879 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
GRIN2AQ12879 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
GRIN2AQ12879 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
GRIN2AQ12879 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
GRIN2AQ12879 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
GRIN2AQ12879 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
GRIN2AQ12879 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
GRIN2AQ12879 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
GRIN2AQ12879 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
GRIN2AQ12879 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
GRIN2AQ12879 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
GRIN2AQ12879 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
GRIN2AQ12879 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
GRIN2AQ12879 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
GRIN2AQ12879 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
GRIN2AQ12879 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
GRIN2AQ12879 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
GRIN2AQ12879 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
GRIN2AQ12879 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
GRIN2AQ12879 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
GRIN2AQ12879 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
GRIN2AQ12879 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
GRIN2AQ12879 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
GRIN2AQ12879 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
GRIN2AQ12879 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
GRIN2AQ12879 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
GRIN2AQ12879 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
GRIN2AQ12879 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
GRIN2AQ12879 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
GRIN2AQ12879 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
GRIN2AQ12879 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
GRIN2AQ12879 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
GRIN2AQ12879 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
GRIN2AQ12879 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
GRIN2AQ12879 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
GRIN2AQ12879 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
GRIN2AQ12879 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
GRIN2AQ12879 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
GRIN2AQ12879 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
GRIN2AQ12879 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
GRIN2AQ12879 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
GRIN2AQ12879 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
GRIN2AQ12879 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
GRIN2AQ12879 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
GRIN2AQ12879 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
GRIN2AQ12879 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
GRIN2AQ12879 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
GRIN2AQ12879 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
GRIN2AQ12879 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
GRIN2AQ12879 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
GRIN2AQ12879 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
GRIN2AQ12879 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
GRIN2AQ12879 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC34.28■■■■□ 3.08
GRIN2AQ12879 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
GRIN2AQ12879 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
GRIN2AQ12879 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
GRIN2AQ12879 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
GRIN2AQ12879 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
GRIN2AQ12879 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
GRIN2AQ12879 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
GRIN2AQ12879 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
GRIN2AQ12879 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
GRIN2AQ12879 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
GRIN2AQ12879 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
GRIN2AQ12879 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
GRIN2AQ12879 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
GRIN2AQ12879 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
GRIN2AQ12879 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
GRIN2AQ12879 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
GRIN2AQ12879 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
GRIN2AQ12879 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
GRIN2AQ12879 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
GRIN2AQ12879 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
GRIN2AQ12879 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
GRIN2AQ12879 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.07
GRIN2AQ12879 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
GRIN2AQ12879 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
GRIN2AQ12879 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
GRIN2AQ12879 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
GRIN2AQ12879 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
GRIN2AQ12879 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
GRIN2AQ12879 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
GRIN2AQ12879 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.8 ms