Protein–RNA interactions for Protein: Q12172

YRR1, Zinc finger transcription factor YRR1, yeastyeast

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRR1Q12172 ATG20YDL113C 1923 nt5.64□□□□□ -1.51
YRR1Q12172 SUM1YDR310C 3189 nt5.63□□□□□ -1.51
YRR1Q12172 YHR193C-AYHR193C-A 375 nt5.63□□□□□ -1.51
YRR1Q12172 RPS16AYMR143W 432 nt5.63□□□□□ -1.51
YRR1Q12172 TMC1YOR052C 453 nt5.63□□□□□ -1.51
YRR1Q12172 YPR059CYPR059C 387 nt5.63□□□□□ -1.51
YRR1Q12172 YPR195CYPR195C 330 nt5.63□□□□□ -1.51
YRR1Q12172 SAC6YDR129C 1929 nt5.63□□□□□ -1.51
YRR1Q12172 BZZ1YHR114W 1902 nt5.63□□□□□ -1.51
YRR1Q12172 THS1YIL078W 2205 nt5.63□□□□□ -1.51
YRR1Q12172 YFL034WYFL034W 3222 nt5.63□□□□□ -1.51
YRR1Q12172 DSN1YIR010W 1731 nt5.62□□□□□ -1.51
YRR1Q12172 CTM1YHR109W 1758 nt5.62□□□□□ -1.51
YRR1Q12172 SWP82YFL049W 1872 nt5.62□□□□□ -1.51
YRR1Q12172 SKN7YHR206W 1869 nt5.62□□□□□ -1.51
YRR1Q12172 YHL034W-AYHL034W-A 462 nt5.62□□□□□ -1.51
YRR1Q12172 YIL060WYIL060W 435 nt5.62□□□□□ -1.51
YRR1Q12172 ABF2YMR072W 552 nt5.62□□□□□ -1.51
YRR1Q12172 RHO2YNL090W 579 nt5.62□□□□□ -1.51
YRR1Q12172 YDR262WYDR262W 819 nt5.61□□□□□ -1.51
YRR1Q12172 OTU1YFL044C 906 nt5.61□□□□□ -1.51
YRR1Q12172 LSG1YGL099W 1923 nt5.61□□□□□ -1.51
YRR1Q12172 DIE2YGR227W 1578 nt5.61□□□□□ -1.51
YRR1Q12172 ERG7YHR072W 2196 nt5.61□□□□□ -1.51
YRR1Q12172 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt5.61□□□□□ -1.51
YRR1Q12172 PHO84YML123C 1764 nt5.61□□□□□ -1.51
YRR1Q12172 YBL044WYBL044W 369 nt5.61□□□□□ -1.51
YRR1Q12172 TOM70YNL121C 1854 nt5.61□□□□□ -1.51
YRR1Q12172 RRD2YPL152W 1077 nt5.61□□□□□ -1.51
YRR1Q12172 TSC3YBR058C-A 243 nt5.61□□□□□ -1.51
YRR1Q12172 MKT1YNL085W 2493 nt5.6□□□□□ -1.51
YRR1Q12172 SLK19YOR195W 2466 nt5.6□□□□□ -1.51
YRR1Q12172 RET1YOR207C 3450 nt5.6□□□□□ -1.51
YRR1Q12172 CAJ1YER048C 1176 nt5.6□□□□□ -1.51
YRR1Q12172 YHR214C-EYHR214C-E 300 nt5.6□□□□□ -1.51
YRR1Q12172 IDH2YOR136W 1110 nt5.6□□□□□ -1.51
YRR1Q12172 SNT2YGL131C 4212 nt5.6□□□□□ -1.51
YRR1Q12172 BAR1YIL015W 1764 nt5.6□□□□□ -1.51
YRR1Q12172 IMD3YLR432W 1572 nt5.59□□□□□ -1.51
YRR1Q12172 SCT1YBL011W 2280 nt5.59□□□□□ -1.51
YRR1Q12172 ARP7YPR034W 1434 nt5.59□□□□□ -1.51
YRR1Q12172 RPP1AYDL081C 321 nt5.59□□□□□ -1.51
YRR1Q12172 YFL015CYFL015C 495 nt5.59□□□□□ -1.51
YRR1Q12172 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt5.59□□□□□ -1.51
YRR1Q12172 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt5.59□□□□□ -1.51
YRR1Q12172 ESF1YDR365C 1887 nt5.59□□□□□ -1.51
YRR1Q12172 RAD52YML032C 1416 nt5.58□□□□□ -1.52
YRR1Q12172 HRK1YOR267C 2280 nt5.58□□□□□ -1.52
YRR1Q12172 YDR134CYDR134C 411 nt5.58□□□□□ -1.52
YRR1Q12172 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt5.58□□□□□ -1.52
YRR1Q12172 FMC1YIL098C 468 nt5.58□□□□□ -1.52
YRR1Q12172 RPL8BYLL045C 771 nt5.58□□□□□ -1.52
YRR1Q12172 RDN58-1RDN58-1 158 nt5.58□□□□□ -1.52
YRR1Q12172 RDN58-2RDN58-2 158 nt5.58□□□□□ -1.52
YRR1Q12172 POL12YBL035C 2118 nt5.58□□□□□ -1.52
YRR1Q12172 GDT1YBR187W 843 nt5.58□□□□□ -1.52
YRR1Q12172 SSZ1YHR064C 1617 nt5.58□□□□□ -1.52
YRR1Q12172 PRM7YDL039C 2097 nt5.57□□□□□ -1.52
YRR1Q12172 TAF12YDR145W 1620 nt5.57□□□□□ -1.52
YRR1Q12172 CSR1YLR380W 1227 nt5.57□□□□□ -1.52
YRR1Q12172 BUD14YAR014C 2130 nt5.57□□□□□ -1.52
YRR1Q12172 YBP1YBR216C 2025 nt5.57□□□□□ -1.52
YRR1Q12172 TPD3YAL016W 1908 nt5.56□□□□□ -1.52
YRR1Q12172 YDL211CYDL211C 1119 nt5.56□□□□□ -1.52
YRR1Q12172 MFA1YDR461W 111 nt5.56□□□□□ -1.52
YRR1Q12172 UTR4YEL038W 684 nt5.56□□□□□ -1.52
YRR1Q12172 YPS5YGL259W 498 nt5.56□□□□□ -1.52
YRR1Q12172 MNT4YNR059W 1743 nt5.56□□□□□ -1.52
YRR1Q12172 STN1YDR082W 1485 nt5.56□□□□□ -1.52
YRR1Q12172 UBA2YDR390C 1911 nt5.55□□□□□ -1.52
YRR1Q12172 VPS52YDR484W 1926 nt5.55□□□□□ -1.52
YRR1Q12172 BCP1YDR361C 852 nt5.55□□□□□ -1.52
YRR1Q12172 CWC21YDR482C 408 nt5.55□□□□□ -1.52
YRR1Q12172 YEL053W-AYEL053W-A 348 nt5.55□□□□□ -1.52
YRR1Q12172 GRX4YER174C 735 nt5.55□□□□□ -1.52
YRR1Q12172 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt5.55□□□□□ -1.52
YRR1Q12172 EPS1YIL005W 2106 nt5.55□□□□□ -1.52
YRR1Q12172 MSL1YIR009W 336 nt5.55□□□□□ -1.52
YRR1Q12172 SDH2YLL041C 801 nt5.55□□□□□ -1.52
YRR1Q12172 YLR076CYLR076C 423 nt5.55□□□□□ -1.52
YRR1Q12172 YPL039WYPL039W 951 nt5.55□□□□□ -1.52
YRR1Q12172 snR49snR49 165 nt5.55□□□□□ -1.52
YRR1Q12172 RNH70YGR276C 1662 nt5.55□□□□□ -1.52
YRR1Q12172 CST6YIL036W 1764 nt5.55□□□□□ -1.52
YRR1Q12172 TRF5YNL299W 1929 nt5.54□□□□□ -1.52
YRR1Q12172 MCM6YGL201C 3054 nt5.54□□□□□ -1.52
YRR1Q12172 YND1YER005W 1893 nt5.54□□□□□ -1.52
YRR1Q12172 GPI8YDR331W 1236 nt5.54□□□□□ -1.52
YRR1Q12172 YKE2YLR200W 345 nt5.54□□□□□ -1.52
YRR1Q12172 HOR7YMR251W-A 180 nt5.54□□□□□ -1.52
YRR1Q12172 DAD3YBR233W-A 285 nt5.54□□□□□ -1.52
YRR1Q12172 REI1YBR267W 1182 nt5.54□□□□□ -1.52
YRR1Q12172 PHO8YDR481C 1701 nt5.54□□□□□ -1.52
YRR1Q12172 CRZ1YNL027W 2037 nt5.53□□□□□ -1.52
YRR1Q12172 ATG21YPL100W 1491 nt5.53□□□□□ -1.52
YRR1Q12172 YOR022CYOR022C 2148 nt5.53□□□□□ -1.52
YRR1Q12172 OPI6YDL096C 327 nt5.53□□□□□ -1.52
YRR1Q12172 YDR344CYDR344C 444 nt5.53□□□□□ -1.52
YRR1Q12172 YGL041CYGL041C 204 nt5.53□□□□□ -1.52
YRR1Q12172 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt5.53□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 30.1 ms