Protein–RNA interactions for Protein: Q05931

SSQ1, Heat shock protein SSQ1, mitochondrial, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSQ1Q05931 TRS130YMR218C 3309 nt2.5□□□□□ -2.01
SSQ1Q05931 RMD5YDR255C 1266 nt2.5□□□□□ -2.01
SSQ1Q05931 POP6YGR030C 477 nt2.5□□□□□ -2.01
SSQ1Q05931 SAY1YGR263C 1275 nt2.5□□□□□ -2.01
SSQ1Q05931 YHL045WYHL045W 348 nt2.5□□□□□ -2.01
SSQ1Q05931 SDO1YLR022C 753 nt2.5□□□□□ -2.01
SSQ1Q05931 MST28YAR033W 705 nt2.5□□□□□ -2.01
SSQ1Q05931 PML39YML107C 1005 nt2.5□□□□□ -2.01
SSQ1Q05931 YNL162W-AYNL162W-A 219 nt2.5□□□□□ -2.01
SSQ1Q05931 TRM112YNR046W 408 nt2.5□□□□□ -2.01
SSQ1Q05931 YOR387CYOR387C 621 nt2.5□□□□□ -2.01
SSQ1Q05931 REG2YBR050C 1017 nt2.5□□□□□ -2.01
SSQ1Q05931 MUM2YBR057C 1101 nt2.5□□□□□ -2.01
SSQ1Q05931 YBT1YLL048C 4986 nt2.5□□□□□ -2.01
SSQ1Q05931 YIL080WYIL080W 4722 nt2.5□□□□□ -2.01
SSQ1Q05931 SPF1YEL031W 3648 nt2.5□□□□□ -2.01
SSQ1Q05931 URB2YJR041C 3525 nt2.5□□□□□ -2.01
SSQ1Q05931 APC5YOR249C 2058 nt2.49□□□□□ -2.01
SSQ1Q05931 YJR061WYJR061W 2808 nt2.49□□□□□ -2.01
SSQ1Q05931 ISC10YER180C 804 nt2.49□□□□□ -2.01
SSQ1Q05931 YGR168CYGR168C 1131 nt2.49□□□□□ -2.01
SSQ1Q05931 YKR070WYKR070W 1059 nt2.49□□□□□ -2.01
SSQ1Q05931 OMA1YKR087C 1038 nt2.49□□□□□ -2.01
SSQ1Q05931 NNT1YLR285W 786 nt2.49□□□□□ -2.01
SSQ1Q05931 CWC24YLR323C 780 nt2.49□□□□□ -2.01
SSQ1Q05931 YOL024WYOL024W 519 nt2.49□□□□□ -2.01
SSQ1Q05931 RPL25YOL127W 429 nt2.49□□□□□ -2.01
SSQ1Q05931 YOR020W-AYOR020W-A 273 nt2.49□□□□□ -2.01
SSQ1Q05931 LTP1YPR073C 486 nt2.49□□□□□ -2.01
SSQ1Q05931 GRX1YCL035C 333 nt2.49□□□□□ -2.01
SSQ1Q05931 MLH1YMR167W 2310 nt2.49□□□□□ -2.01
SSQ1Q05931 CLN2YPL256C 1638 nt2.49□□□□□ -2.01
SSQ1Q05931 FRE8YLR047C 2061 nt2.48□□□□□ -2.01
SSQ1Q05931 HBT1YDL223C 3141 nt2.48□□□□□ -2.01
SSQ1Q05931 YDL026WYDL026W 312 nt2.48□□□□□ -2.01
SSQ1Q05931 TIM11YDR322C-A 291 nt2.48□□□□□ -2.01
SSQ1Q05931 YGL138CYGL138C 1038 nt2.48□□□□□ -2.01
SSQ1Q05931 ARI1YGL157W 1044 nt2.48□□□□□ -2.01
SSQ1Q05931 MBB1YJL199C 327 nt2.48□□□□□ -2.01
SSQ1Q05931 MSN1YOL116W 1149 nt2.48□□□□□ -2.01
SSQ1Q05931 YOL134CYOL134C 390 nt2.48□□□□□ -2.01
SSQ1Q05931 SSP2YOR242C 1116 nt2.48□□□□□ -2.01
SSQ1Q05931 PDR1YGL013C 3207 nt2.48□□□□□ -2.01
SSQ1Q05931 MAK5YBR142W 2322 nt2.48□□□□□ -2.01
SSQ1Q05931 PTP3YER075C 2787 nt2.48□□□□□ -2.01
SSQ1Q05931 TOF1YNL273W 3717 nt2.47□□□□□ -2.01
SSQ1Q05931 HAA1YPR008W 2085 nt2.47□□□□□ -2.01
SSQ1Q05931 NHP10YDL002C 612 nt2.47□□□□□ -2.01
SSQ1Q05931 YDR290WYDR290W 330 nt2.47□□□□□ -2.01
SSQ1Q05931 YML047W-AYML047W-A 366 nt2.47□□□□□ -2.01
SSQ1Q05931 YNL035CYNL035C 1170 nt2.47□□□□□ -2.01
SSQ1Q05931 YPR074W-AYPR074W-A 171 nt2.47□□□□□ -2.01
SSQ1Q05931 KHA1YJL094C 2622 nt2.47□□□□□ -2.01
SSQ1Q05931 UTP15YMR093W 1542 nt2.47□□□□□ -2.01
SSQ1Q05931 VPS64YDR200C 1815 nt2.47□□□□□ -2.01
SSQ1Q05931 JIP5YPR169W 1479 nt2.46□□□□□ -2.02
SSQ1Q05931 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.46□□□□□ -2.02
SSQ1Q05931 RSE1YML049C 4086 nt2.46□□□□□ -2.02
SSQ1Q05931 NEL1YHR035W 1893 nt2.46□□□□□ -2.02
SSQ1Q05931 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.46□□□□□ -2.02
SSQ1Q05931 BET3YKR068C 582 nt2.46□□□□□ -2.02
SSQ1Q05931 YPR142CYPR142C 564 nt2.46□□□□□ -2.02
SSQ1Q05931 CBP6YBR120C 489 nt2.46□□□□□ -2.02
SSQ1Q05931 NUF2YOL069W 1356 nt2.46□□□□□ -2.02
SSQ1Q05931 SWA2YDR320C 2007 nt2.46□□□□□ -2.02
SSQ1Q05931 YJL181WYJL181W 1836 nt2.45□□□□□ -2.02
SSQ1Q05931 YDL186WYDL186W 834 nt2.45□□□□□ -2.02
SSQ1Q05931 RSR1YGR152C 819 nt2.45□□□□□ -2.02
SSQ1Q05931 ARC19YKL013C 516 nt2.45□□□□□ -2.02
SSQ1Q05931 PEX17YNL214W 600 nt2.45□□□□□ -2.02
SSQ1Q05931 TEX1YNL253W 1269 nt2.45□□□□□ -2.02
SSQ1Q05931 DAD3YBR233W-A 285 nt2.45□□□□□ -2.02
SSQ1Q05931 YCL001W-AYCL001W-A 462 nt2.45□□□□□ -2.02
SSQ1Q05931 PSP1YDR505C 2526 nt2.45□□□□□ -2.02
SSQ1Q05931 AMS1YGL156W 3252 nt2.44□□□□□ -2.02
SSQ1Q05931 NEW1YPL226W 3591 nt2.44□□□□□ -2.02
SSQ1Q05931 DNA2YHR164C 4569 nt2.44□□□□□ -2.02
SSQ1Q05931 WHI3YNL197C 1986 nt2.44□□□□□ -2.02
SSQ1Q05931 TSC13YDL015C 933 nt2.44□□□□□ -2.02
SSQ1Q05931 YFH1YDL120W 525 nt2.44□□□□□ -2.02
SSQ1Q05931 YGL118CYGL118C 438 nt2.44□□□□□ -2.02
SSQ1Q05931 YGL258W-AYGL258W-A 234 nt2.44□□□□□ -2.02
SSQ1Q05931 MMF1YIL051C 438 nt2.44□□□□□ -2.02
SSQ1Q05931 YIL068W-AYIL068W-A 384 nt2.44□□□□□ -2.02
SSQ1Q05931 YIL161WYIL161W 708 nt2.44□□□□□ -2.02
SSQ1Q05931 RNR2YJL026W 1200 nt2.44□□□□□ -2.02
SSQ1Q05931 SFT1YKL006C-A 294 nt2.44□□□□□ -2.02
SSQ1Q05931 EBP2YKL172W 1284 nt2.44□□□□□ -2.02
SSQ1Q05931 YLR311CYLR311C 348 nt2.44□□□□□ -2.02
SSQ1Q05931 YLR363W-AYLR363W-A 258 nt2.44□□□□□ -2.02
SSQ1Q05931 SPO20YMR017W 1194 nt2.44□□□□□ -2.02
SSQ1Q05931 YSF3YNL138W-A 258 nt2.44□□□□□ -2.02
SSQ1Q05931 TPT1YOL102C 693 nt2.44□□□□□ -2.02
SSQ1Q05931 JID1YPR061C 906 nt2.44□□□□□ -2.02
SSQ1Q05931 RPN4YDL020C 1596 nt2.44□□□□□ -2.02
SSQ1Q05931 SVL3YPL032C 2478 nt2.44□□□□□ -2.02
SSQ1Q05931 YNL193WYNL193W 1677 nt2.44□□□□□ -2.02
SSQ1Q05931 CSF1YLR087C 8877 nt2.44□□□□□ -2.02
SSQ1Q05931 FKS3YMR306W 5358 nt2.43□□□□□ -2.02
SSQ1Q05931 POL4YCR014C 1749 nt2.43□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 29.9 ms