Protein–RNA interactions for Protein: O15146

MUSK, Muscle, skeletal receptor tyrosine-protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUSKO15146 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MUSKO15146 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MUSKO15146 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MUSKO15146 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MUSKO15146 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MUSKO15146 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MUSKO15146 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MUSKO15146 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MUSKO15146 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MUSKO15146 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MUSKO15146 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MUSKO15146 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MUSKO15146 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MUSKO15146 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
MUSKO15146 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MUSKO15146 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MUSKO15146 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MUSKO15146 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MUSKO15146 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MUSKO15146 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MUSKO15146 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MUSKO15146 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MUSKO15146 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MUSKO15146 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MUSKO15146 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MUSKO15146 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MUSKO15146 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
MUSKO15146 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MUSKO15146 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MUSKO15146 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MUSKO15146 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MUSKO15146 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MUSKO15146 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MUSKO15146 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
MUSKO15146 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MUSKO15146 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MUSKO15146 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MUSKO15146 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MUSKO15146 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MUSKO15146 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MUSKO15146 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MUSKO15146 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MUSKO15146 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MUSKO15146 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MUSKO15146 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MUSKO15146 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MUSKO15146 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MUSKO15146 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MUSKO15146 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MUSKO15146 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MUSKO15146 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MUSKO15146 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MUSKO15146 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MUSKO15146 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MUSKO15146 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MUSKO15146 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MUSKO15146 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MUSKO15146 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MUSKO15146 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MUSKO15146 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MUSKO15146 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MUSKO15146 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MUSKO15146 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MUSKO15146 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MUSKO15146 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MUSKO15146 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MUSKO15146 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MUSKO15146 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MUSKO15146 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MUSKO15146 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MUSKO15146 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MUSKO15146 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MUSKO15146 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MUSKO15146 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MUSKO15146 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MUSKO15146 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MUSKO15146 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MUSKO15146 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MUSKO15146 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MUSKO15146 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MUSKO15146 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MUSKO15146 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MUSKO15146 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MUSKO15146 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MUSKO15146 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MUSKO15146 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MUSKO15146 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MUSKO15146 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MUSKO15146 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MUSKO15146 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MUSKO15146 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MUSKO15146 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MUSKO15146 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MUSKO15146 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MUSKO15146 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MUSKO15146 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MUSKO15146 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MUSKO15146 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MUSKO15146 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MUSKO15146 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms