Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I1

NISCH, Nischarin, humanhuman

Predictions only

Length 1,504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCHQ9Y2I1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC63.67■■■■■ 7.78
NISCHQ9Y2I1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC63.67■■■■■ 7.78
NISCHQ9Y2I1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC63.66■■■■■ 7.78
NISCHQ9Y2I1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC63.65■■■■■ 7.78
NISCHQ9Y2I1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC63.65■■■■■ 7.78
NISCHQ9Y2I1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC63.64■■■■■ 7.78
NISCHQ9Y2I1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC63.64■■■■■ 7.78
NISCHQ9Y2I1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC63.63■■■■■ 7.78
NISCHQ9Y2I1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC63.63■■■■■ 7.78
NISCHQ9Y2I1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC63.62■■■■■ 7.77
NISCHQ9Y2I1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC63.62■■■■■ 7.77
NISCHQ9Y2I1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC63.62■■■■■ 7.77
NISCHQ9Y2I1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC63.62■■■■■ 7.77
NISCHQ9Y2I1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC63.61■■■■■ 7.77
NISCHQ9Y2I1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC63.6■■■■■ 7.77
NISCHQ9Y2I1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC63.6■■■■■ 7.77
NISCHQ9Y2I1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC63.6■■■■■ 7.77
NISCHQ9Y2I1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC63.58■■■■■ 7.77
NISCHQ9Y2I1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC63.57■■■■■ 7.77
NISCHQ9Y2I1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC63.56■■■■■ 7.77
NISCHQ9Y2I1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC63.54■■■■■ 7.76
NISCHQ9Y2I1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC63.53■■■■■ 7.76
NISCHQ9Y2I1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC63.5■■■■■ 7.76
NISCHQ9Y2I1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC63.48■■■■■ 7.75
NISCHQ9Y2I1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC63.48■■■■■ 7.75
NISCHQ9Y2I1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC63.48■■■■■ 7.75
NISCHQ9Y2I1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC63.47■■■■■ 7.75
NISCHQ9Y2I1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC63.46■■■■■ 7.75
NISCHQ9Y2I1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC63.45■■■■■ 7.75
NISCHQ9Y2I1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC63.45■■■■■ 7.75
NISCHQ9Y2I1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC63.42■■■■■ 7.74
NISCHQ9Y2I1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC63.42■■■■■ 7.74
NISCHQ9Y2I1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC63.42■■■■■ 7.74
NISCHQ9Y2I1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC63.42■■■■■ 7.74
NISCHQ9Y2I1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC63.42■■■■■ 7.74
NISCHQ9Y2I1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC63.41■■■■■ 7.74
NISCHQ9Y2I1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC63.41■■■■■ 7.74
NISCHQ9Y2I1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC63.36■■■■■ 7.73
NISCHQ9Y2I1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC63.35■■■■■ 7.73
NISCHQ9Y2I1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC63.33■■■■■ 7.73
NISCHQ9Y2I1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC63.32■■■■■ 7.73
NISCHQ9Y2I1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC63.3■■■■■ 7.72
NISCHQ9Y2I1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC63.3■■■■■ 7.72
NISCHQ9Y2I1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC63.29■■■■■ 7.72
NISCHQ9Y2I1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC63.29■■■■■ 7.72
NISCHQ9Y2I1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC63.28■■■■■ 7.72
NISCHQ9Y2I1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC63.27■■■■■ 7.72
NISCHQ9Y2I1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC63.25■■■■■ 7.72
NISCHQ9Y2I1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC63.25■■■■■ 7.72
NISCHQ9Y2I1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC63.21■■■■■ 7.71
NISCHQ9Y2I1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC63.2■■■■■ 7.71
NISCHQ9Y2I1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC63.2■■■■■ 7.71
NISCHQ9Y2I1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC63.2■■■■■ 7.71
NISCHQ9Y2I1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC63.19■■■■■ 7.71
NISCHQ9Y2I1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC63.17■■■■■ 7.7
NISCHQ9Y2I1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC63.16■■■■■ 7.7
NISCHQ9Y2I1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC63.14■■■■■ 7.7
NISCHQ9Y2I1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC63.14■■■■■ 7.7
NISCHQ9Y2I1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC63.14■■■■■ 7.7
NISCHQ9Y2I1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC63.12■■■■■ 7.7
NISCHQ9Y2I1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC63.1■■■■■ 7.69
NISCHQ9Y2I1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC63.1■■■■■ 7.69
NISCHQ9Y2I1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC63.1■■■■■ 7.69
NISCHQ9Y2I1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC63.08■■■■■ 7.69
NISCHQ9Y2I1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC63.07■■■■■ 7.69
NISCHQ9Y2I1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC63.05■■■■■ 7.68
NISCHQ9Y2I1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC63.03■■■■■ 7.68
NISCHQ9Y2I1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC63.01■■■■■ 7.68
NISCHQ9Y2I1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC63.01■■■■■ 7.68
NISCHQ9Y2I1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC63.01■■■■■ 7.68
NISCHQ9Y2I1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC63■■■■■ 7.68
NISCHQ9Y2I1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC62.98■■■■■ 7.67
NISCHQ9Y2I1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC62.98■■■■■ 7.67
NISCHQ9Y2I1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC62.98■■■■■ 7.67
NISCHQ9Y2I1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC62.98■■■■■ 7.67
NISCHQ9Y2I1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC62.97■■■■■ 7.67
NISCHQ9Y2I1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC62.95■■■■■ 7.67
NISCHQ9Y2I1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC62.92■■■■■ 7.66
NISCHQ9Y2I1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC62.92■■■■■ 7.66
NISCHQ9Y2I1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC62.92■■■■■ 7.66
NISCHQ9Y2I1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC62.9■■■■■ 7.66
NISCHQ9Y2I1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC62.89■■■■■ 7.66
NISCHQ9Y2I1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC62.88■■■■■ 7.66
NISCHQ9Y2I1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC62.88■■■■■ 7.66
NISCHQ9Y2I1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC62.81■■■■■ 7.64
NISCHQ9Y2I1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC62.8■■■■■ 7.64
NISCHQ9Y2I1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC62.8■■■■■ 7.64
NISCHQ9Y2I1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC62.79■■■■■ 7.64
NISCHQ9Y2I1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC62.79■■■■■ 7.64
NISCHQ9Y2I1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC62.79■■■■■ 7.64
NISCHQ9Y2I1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC62.79■■■■■ 7.64
NISCHQ9Y2I1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC62.79■■■■■ 7.64
NISCHQ9Y2I1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC62.79■■■■■ 7.64
NISCHQ9Y2I1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC62.79■■■■■ 7.64
NISCHQ9Y2I1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC62.79■■■■■ 7.64
NISCHQ9Y2I1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC62.79■■■■■ 7.64
NISCHQ9Y2I1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC62.79■■■■■ 7.64
NISCHQ9Y2I1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC62.77■■■■■ 7.64
NISCHQ9Y2I1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC62.76■■■■■ 7.64
NISCHQ9Y2I1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC62.76■■■■■ 7.64
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