Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT4

EXOSC5, Exosome complex component RRP46, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC5Q9NQT4 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.533e-7■■■■■ 48.6
EXOSC5Q9NQT4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.362e-10■■■■■ 48.4
EXOSC5Q9NQT4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.132e-10■■■■■ 48.4
EXOSC5Q9NQT4 ZPBP-206ENST00000491129 610 ntTSL 33.95□□□□□ -1.782e-10■■■■■ 48.4
EXOSC5Q9NQT4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.054e-7■■■■■ 48.3
EXOSC5Q9NQT4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.024e-7■■■■■ 48.3
EXOSC5Q9NQT4 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.349e-7■■■■■ 48.3
EXOSC5Q9NQT4 USP10-202ENST00000540269 3070 ntTSL 1 (best)10.77□□□□□ -0.699e-7■■■■■ 48.3
EXOSC5Q9NQT4 USP10-219ENST00000570191 2717 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.779e-7■■■■■ 48.3
EXOSC5Q9NQT4 USP10-207ENST00000563048 1315 ntTSL 29.27□□□□□ -0.939e-7■■■■■ 48.3
EXOSC5Q9NQT4 ZNF678-203ENST00000440339 798 ntTSL 28.58□□□□□ -1.042e-8■■■■■ 48.1
EXOSC5Q9NQT4 ZNF678-205ENST00000608949 929 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.262e-8■■■■■ 48.1
EXOSC5Q9NQT4 ZNF678-204ENST00000465266 533 ntTSL 45.98□□□□□ -1.452e-8■■■■■ 48.1
EXOSC5Q9NQT4 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.632e-8■■■■■ 48.1
EXOSC5Q9NQT4 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.197e-15■■■■■ 48
EXOSC5Q9NQT4 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.217e-15■■■■■ 48
EXOSC5Q9NQT4 KIF18B-202ENST00000587309 4217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.927e-15■■■■■ 48
EXOSC5Q9NQT4 CENPC-201ENST00000273853 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.952e-7■■■■■ 47.9
EXOSC5Q9NQT4 CENPC-203ENST00000506882 3436 ntTSL 1 (best)9□□□□□ -0.972e-7■■■■■ 47.9
EXOSC5Q9NQT4 CENPC-206ENST00000513216 2799 ntTSL 53.46□□□□□ -1.862e-7■■■■■ 47.9
EXOSC5Q9NQT4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.226e-10■■■■■ 47.5
EXOSC5Q9NQT4 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.036e-10■■■■■ 47.5
EXOSC5Q9NQT4 RPH3AL-207ENST00000572075 569 ntTSL 413.88□□□□□ -0.196e-10■■■■■ 47.5
EXOSC5Q9NQT4 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.286e-10■■■■■ 47.5
EXOSC5Q9NQT4 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.286e-10■■■■■ 47.5
EXOSC5Q9NQT4 RPH3AL-205ENST00000570893 594 ntTSL 313.11□□□□□ -0.316e-10■■■■■ 47.5
EXOSC5Q9NQT4 RPH3AL-219ENST00000576001 647 ntTSL 312.23□□□□□ -0.456e-10■■■■■ 47.5
EXOSC5Q9NQT4 RPH3AL-206ENST00000570954 568 ntTSL 410.16□□□□□ -0.786e-10■■■■■ 47.5
EXOSC5Q9NQT4 SUPT3H-205ENST00000475057 1377 ntTSL 26.59□□□□□ -1.354e-7■■■■■ 47.4
EXOSC5Q9NQT4 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.544e-7■■■■■ 47.4
EXOSC5Q9NQT4 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.644e-7■■■■■ 47.4
EXOSC5Q9NQT4 SUPT3H-204ENST00000459689 396 ntTSL 23.74□□□□□ -1.814e-7■■■■■ 47.4
EXOSC5Q9NQT4 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.362e-7■■■■■ 47.3
EXOSC5Q9NQT4 XPR1-202ENST00000367590 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.872e-7■■■■■ 47.3
EXOSC5Q9NQT4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.246e-7■■■■■ 47.2
EXOSC5Q9NQT4 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.166e-7■■■■■ 47.2
EXOSC5Q9NQT4 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.376e-7■■■■■ 47.2
EXOSC5Q9NQT4 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.456e-7■■■■■ 47.2
EXOSC5Q9NQT4 AGFG1-203ENST00000409171 1783 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.926e-7■■■■■ 47.2
EXOSC5Q9NQT4 AGFG1-207ENST00000458212 815 ntTSL 23.84□□□□□ -1.796e-7■■■■■ 47.2
EXOSC5Q9NQT4 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.613e-8■■■■■ 47.2
EXOSC5Q9NQT4 AC069277.1-201ENST00000433639 1083 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.93e-8■■■■■ 47.2
EXOSC5Q9NQT4 AC069277.1-203ENST00000414603 517 ntTSL 38.22□□□□□ -1.093e-8■■■■■ 47.2
EXOSC5Q9NQT4 AC069277.1-204ENST00000342990 246 ntTSL 36.89□□□□□ -1.313e-8■■■■■ 47.2
EXOSC5Q9NQT4 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.748e-8■■■■■ 46.8
EXOSC5Q9NQT4 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.351e-12■■■■■ 46.8
EXOSC5Q9NQT4 FCHSD2-206ENST00000422375 587 ntTSL 410.28□□□□□ -0.761e-12■■■■■ 46.8
EXOSC5Q9NQT4 FCHSD2-203ENST00000409314 4509 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.41e-12■■■■■ 46.8
EXOSC5Q9NQT4 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.481e-12■■■■■ 46.8
EXOSC5Q9NQT4 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.491e-12■■■■■ 46.8
EXOSC5Q9NQT4 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.731e-12■■■■■ 46.8
EXOSC5Q9NQT4 DLEU1-203ENST00000461527 917 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.671e-6■■■■■ 46.5
EXOSC5Q9NQT4 DLEU1-231ENST00000490577 2440 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.721e-6■■■■■ 46.5
EXOSC5Q9NQT4 DLEU1-218ENST00000475913 534 ntTSL 1 (best)9.83□□□□□ -0.841e-6■■■■■ 46.5
EXOSC5Q9NQT4 DLEU1-232ENST00000491341 1141 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.871e-6■■■■■ 46.5
EXOSC5Q9NQT4 DLEU1-219ENST00000476738 838 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.881e-6■■■■■ 46.5
EXOSC5Q9NQT4 DLEU1-208ENST00000468168 982 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.91e-6■■■■■ 46.5
EXOSC5Q9NQT4 DLEU1-229ENST00000486895 481 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.981e-6■■■■■ 46.5
EXOSC5Q9NQT4 DLEU1-207ENST00000467721 1455 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.991e-6■■■■■ 46.5
EXOSC5Q9NQT4 DLEU1-234ENST00000491615 1451 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.011e-6■■■■■ 46.5
EXOSC5Q9NQT4 DLEU1-209ENST00000468522 1158 ntTSL 5 BASIC8.68□□□□□ -1.021e-6■■■■■ 46.5
EXOSC5Q9NQT4 DLEU1-206ENST00000463474 1048 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.191e-6■■■■■ 46.5
EXOSC5Q9NQT4 DLEU1-228ENST00000485007 736 ntTSL 57.56□□□□□ -1.21e-6■■■■■ 46.5
EXOSC5Q9NQT4 DLEU1-225ENST00000484529 400 ntTSL 1 (best)7.33□□□□□ -1.241e-6■■■■■ 46.5
EXOSC5Q9NQT4 DLEU1-211ENST00000469127 320 ntTSL 56.72□□□□□ -1.331e-6■■■■■ 46.5
EXOSC5Q9NQT4 DLEU1-216ENST00000473075 348 ntTSL 53.63□□□□□ -1.831e-6■■■■■ 46.5
EXOSC5Q9NQT4 DLEU1-224ENST00000483444 332 ntTSL 1 (best)3.15□□□□□ -1.911e-6■■■■■ 46.5
EXOSC5Q9NQT4 ARHGAP32-204ENST00000525234 719 ntTSL 323.98■■□□□ 1.437e-7■■■■■ 46.4
EXOSC5Q9NQT4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.87e-7■■■■■ 46.4
EXOSC5Q9NQT4 GNB1-207ENST00000472614 708 ntTSL 218.42■□□□□ 0.547e-7■■■■■ 46.4
EXOSC5Q9NQT4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.527e-7■■■■■ 46.4
EXOSC5Q9NQT4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.267e-7■■■■■ 46.4
EXOSC5Q9NQT4 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.087e-7■■■■■ 46.4
EXOSC5Q9NQT4 GNB1-202ENST00000434686 684 ntTSL 39.09□□□□□ -0.957e-7■■■■■ 46.4
EXOSC5Q9NQT4 GNB1-204ENST00000439272 602 ntTSL 57.7□□□□□ -1.187e-7■■■■■ 46.4
EXOSC5Q9NQT4 STK4-202ENST00000372806 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.327e-7■■■■■ 46.4
EXOSC5Q9NQT4 STK4-207ENST00000499879 6161 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.377e-7■■■■■ 46.4
EXOSC5Q9NQT4 ARHGAP32-201ENST00000310343 10111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.417e-7■■■■■ 46.4
EXOSC5Q9NQT4 ARHGAP32-203ENST00000524655 8194 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.427e-7■■■■■ 46.4
EXOSC5Q9NQT4 ANKRD11-213ENST00000567736 2750 ntTSL 213.15□□□□□ -0.34e-10■■■■■ 46.4
EXOSC5Q9NQT4 ANKRD11-202ENST00000330736 8342 ntTSL 512.55□□□□□ -0.44e-10■■■■■ 46.4
EXOSC5Q9NQT4 ANKRD11-210ENST00000566858 580 ntTSL 412.49□□□□□ -0.414e-10■■■■■ 46.4
EXOSC5Q9NQT4 ANKRD11-212ENST00000567699 412 ntTSL 512.23□□□□□ -0.454e-10■■■■■ 46.4
EXOSC5Q9NQT4 ANKRD11-206ENST00000562275 2762 ntTSL 512.17□□□□□ -0.464e-10■■■■■ 46.4
EXOSC5Q9NQT4 PRH1-205ENST00000541977 507 ntTSL 211.56□□□□□ -0.564e-10■■■■■ 46.4
EXOSC5Q9NQT4 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.614e-10■■■■■ 46.4
EXOSC5Q9NQT4 TAS2R14-201ENST00000381852 1662 ntTSL 210.31□□□□□ -0.764e-10■■■■■ 46.4
EXOSC5Q9NQT4 PRR4-213ENST00000546265 534 ntTSL 59.73□□□□□ -0.854e-10■■■■■ 46.4
EXOSC5Q9NQT4 PRR4-203ENST00000535024 889 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.854e-10■■■■■ 46.4
EXOSC5Q9NQT4 AC018630.6-201ENST00000536668 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.884e-10■■■■■ 46.4
EXOSC5Q9NQT4 MAN1B1-209ENST00000536349 5048 ntTSL 213.65□□□□□ -0.227e-8■■■■■ 46.3
EXOSC5Q9NQT4 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.756e-7■■■■■ 46.2
EXOSC5Q9NQT4 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.066e-7■■■■■ 46.2
EXOSC5Q9NQT4 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.076e-7■■■■■ 46.2
EXOSC5Q9NQT4 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.226e-7■■■■■ 46.2
EXOSC5Q9NQT4 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.8□□□□□ -2.286e-7■■■■■ 46.2
EXOSC5Q9NQT4 FRG2KP-202ENST00000568403 827 ntBASIC7.76□□□□□ -1.177e-11■■■■■ 46.2
EXOSC5Q9NQT4 FRG2KP-201ENST00000565692 971 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.257e-11■■■■■ 46.2
EXOSC5Q9NQT4 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.784e-8■■■■■ 46.2
EXOSC5Q9NQT4 NUTM2A-AS1-211ENST00000456104 486 ntTSL 311.85□□□□□ -0.513e-9■■■■■ 45.9
Retrieved 100 of 8,799 protein–RNA pairs in 163.6 ms