RNAct
Search
Pairwise
Browse
Proteins
RNAs
Download
About
Search
Protein–RNA interactions for Protein: Q12241
VAM3, Syntaxin VAM3, yeast
Predictions only
Length
283 aa
.
Download Table
Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
VAM3
Q12241
MCM5
YLR274W
2328 nt
8.09
□□□□□ -1.11
VAM3
Q12241
ALP1
YNL270C
1722 nt
8.09
□□□□□ -1.11
VAM3
Q12241
HIS2
YFR025C
1008 nt
8.08
□□□□□ -1.12
VAM3
Q12241
TOA2
YKL058W
369 nt
8.08
□□□□□ -1.12
VAM3
Q12241
PET8
YNL003C
855 nt
8.08
□□□□□ -1.12
VAM3
Q12241
AKR2
YOR034C
2250 nt
8.08
□□□□□ -1.12
VAM3
Q12241
OYE3
YPL171C
1203 nt
8.07
□□□□□ -1.12
VAM3
Q12241
BRR1
YPR057W
1026 nt
8.07
□□□□□ -1.12
VAM3
Q12241
CCT2
YIL142W
1584 nt
8.05
□□□□□ -1.12
VAM3
Q12241
COQ8
YGL119W
1506 nt
8.05
□□□□□ -1.12
VAM3
Q12241
TSC10
YBR265W
963 nt
8.05
□□□□□ -1.12
VAM3
Q12241
YPL251W
YPL251W
303 nt
8.04
□□□□□ -1.12
VAM3
Q12241
Q0010
Q0010
387 nt
8.04
□□□□□ -1.12
VAM3
Q12241
GLR1
YPL091W
1452 nt
8.02
□□□□□ -1.13
VAM3
Q12241
TRT2
tT(CGU)K
72 nt
8.02
□□□□□ -1.13
VAM3
Q12241
NME1
NME1
340 nt
8.02
□□□□□ -1.13
VAM3
Q12241
ARO8
YGL202W
1503 nt
8.02
□□□□□ -1.13
VAM3
Q12241
GND2
YGR256W
1479 nt
8.01
□□□□□ -1.13
VAM3
Q12241
SBA1
YKL117W
651 nt
8.01
□□□□□ -1.13
VAM3
Q12241
ZTA1
YBR046C
1005 nt
8.01
□□□□□ -1.13
VAM3
Q12241
SDH5
YOL071W
489 nt
8
□□□□□ -1.13
VAM3
Q12241
SAM2
YDR502C
1155 nt
7.99
□□□□□ -1.13
VAM3
Q12241
KES1
YPL145C
1305 nt
7.99
□□□□□ -1.13
VAM3
Q12241
YLR279W
YLR279W
390 nt
7.98
□□□□□ -1.13
VAM3
Q12241
MEP3
YPR138C
1470 nt
7.98
□□□□□ -1.13
VAM3
Q12241
UGP1
YKL035W
1500 nt
7.98
□□□□□ -1.13
VAM3
Q12241
VPS62
YGR141W
1404 nt
7.97
□□□□□ -1.13
VAM3
Q12241
YGR012W
YGR012W
1182 nt
7.97
□□□□□ -1.13
VAM3
Q12241
SPP2
YOR148C
558 nt
7.97
□□□□□ -1.13
VAM3
Q12241
BET2
YPR176C
978 nt
7.97
□□□□□ -1.13
VAM3
Q12241
SGA1
YIL099W
1650 nt
7.96
□□□□□ -1.13
VAM3
Q12241
YMR209C
YMR209C
1374 nt
7.96
□□□□□ -1.14
VAM3
Q12241
FMS1
YMR020W
1527 nt
7.95
□□□□□ -1.14
VAM3
Q12241
YDL086W
YDL086W
822 nt
7.95
□□□□□ -1.14
VAM3
Q12241
RAD23
YEL037C
1197 nt
7.95
□□□□□ -1.14
VAM3
Q12241
YMR103C
YMR103C
363 nt
7.95
□□□□□ -1.14
VAM3
Q12241
RSC8
YFR037C
1674 nt
7.95
□□□□□ -1.14
VAM3
Q12241
YMR244W
YMR244W
1068 nt
7.94
□□□□□ -1.14
VAM3
Q12241
LSB6
YJL100W
1824 nt
7.94
□□□□□ -1.14
VAM3
Q12241
YLR111W
YLR111W
333 nt
7.93
□□□□□ -1.14
VAM3
Q12241
SEC61
YLR378C
1443 nt
7.93
□□□□□ -1.14
VAM3
Q12241
MSB4
YOL112W
1479 nt
7.93
□□□□□ -1.14
VAM3
Q12241
ACH1
YBL015W
1581 nt
7.93
□□□□□ -1.14
VAM3
Q12241
YJR154W
YJR154W
1041 nt
7.92
□□□□□ -1.14
VAM3
Q12241
YMR226C
YMR226C
804 nt
7.92
□□□□□ -1.14
VAM3
Q12241
OXA1
YER154W
1209 nt
7.91
□□□□□ -1.14
VAM3
Q12241
YPS3
YLR121C
1527 nt
7.91
□□□□□ -1.14
VAM3
Q12241
QDR2
YIL121W
1629 nt
7.9
□□□□□ -1.14
VAM3
Q12241
FLR1
YBR008C
1647 nt
7.89
□□□□□ -1.15
VAM3
Q12241
DIG1
YPL049C
1359 nt
7.88
□□□□□ -1.15
VAM3
Q12241
YLR173W
YLR173W
1827 nt
7.88
□□□□□ -1.15
VAM3
Q12241
DLD2
YDL178W
1593 nt
7.88
□□□□□ -1.15
VAM3
Q12241
APT2
YDR441C
546 nt
7.87
□□□□□ -1.15
VAM3
Q12241
RIB3
YDR487C
627 nt
7.87
□□□□□ -1.15
VAM3
Q12241
TOM71
YHR117W
1920 nt
7.86
□□□□□ -1.15
VAM3
Q12241
YRF1-2
YER190W
5046 nt
7.86
□□□□□ -1.15
VAM3
Q12241
NSG2
YNL156C
900 nt
7.86
□□□□□ -1.15
VAM3
Q12241
YPL222C-A
YPL222C-A
246 nt
7.86
□□□□□ -1.15
VAM3
Q12241
YDR306C
YDR306C
1437 nt
7.86
□□□□□ -1.15
VAM3
Q12241
ZAP1
YJL056C
2643 nt
7.85
□□□□□ -1.15
VAM3
Q12241
MTO1
YGL236C
2010 nt
7.85
□□□□□ -1.15
VAM3
Q12241
CYT1
YOR065W
930 nt
7.85
□□□□□ -1.15
VAM3
Q12241
FCY21
YER060W
1587 nt
7.84
□□□□□ -1.15
VAM3
Q12241
PSD1
YNL169C
1503 nt
7.84
□□□□□ -1.15
VAM3
Q12241
YHL008C
YHL008C
1884 nt
7.83
□□□□□ -1.16
VAM3
Q12241
SFL1
YOR140W
2301 nt
7.83
□□□□□ -1.16
VAM3
Q12241
HXK1
YFR053C
1458 nt
7.82
□□□□□ -1.16
VAM3
Q12241
CAB5
YDR196C
726 nt
7.82
□□□□□ -1.16
VAM3
Q12241
YER188W
YER188W
720 nt
7.82
□□□□□ -1.16
VAM3
Q12241
TPN1
YGL186C
1740 nt
7.82
□□□□□ -1.16
VAM3
Q12241
RBG2
YGR173W
1107 nt
7.82
□□□□□ -1.16
VAM3
Q12241
YLR437C-A
YLR437C-A
228 nt
7.82
□□□□□ -1.16
VAM3
Q12241
DMA2
YNL116W
1569 nt
7.82
□□□□□ -1.16
VAM3
Q12241
ALR1
YOL130W
2580 nt
7.82
□□□□□ -1.16
VAM3
Q12241
GID8
YMR135C
1368 nt
7.81
□□□□□ -1.16
VAM3
Q12241
PHO23
YNL097C
993 nt
7.8
□□□□□ -1.16
VAM3
Q12241
GND1
YHR183W
1470 nt
7.8
□□□□□ -1.16
VAM3
Q12241
BNI5
YNL166C
1347 nt
7.79
□□□□□ -1.16
VAM3
Q12241
MSC1
YML128C
1542 nt
7.78
□□□□□ -1.16
VAM3
Q12241
HEM13
YDR044W
987 nt
7.78
□□□□□ -1.16
VAM3
Q12241
ODC1
YPL134C
933 nt
7.78
□□□□□ -1.16
VAM3
Q12241
OSH7
YHR001W
1314 nt
7.78
□□□□□ -1.16
VAM3
Q12241
GNP1
YDR508C
1992 nt
7.77
□□□□□ -1.17
VAM3
Q12241
YKL133C
YKL133C
1392 nt
7.76
□□□□□ -1.17
VAM3
Q12241
FUB1
YCR076C
753 nt
7.76
□□□□□ -1.17
VAM3
Q12241
PUS7
YOR243C
2031 nt
7.75
□□□□□ -1.17
VAM3
Q12241
LOT5
YKL183W
921 nt
7.75
□□□□□ -1.17
VAM3
Q12241
SMM1
YNR015W
1155 nt
7.75
□□□□□ -1.17
VAM3
Q12241
ALD5
YER073W
1563 nt
7.75
□□□□□ -1.17
VAM3
Q12241
MRS6
YOR370C
1812 nt
7.74
□□□□□ -1.17
VAM3
Q12241
PRY1
YJL079C
900 nt
7.74
□□□□□ -1.17
VAM3
Q12241
NUC1
YJL208C
990 nt
7.74
□□□□□ -1.17
VAM3
Q12241
DUR3
YHL016C
2208 nt
7.74
□□□□□ -1.17
VAM3
Q12241
SSL2
YIL143C
2532 nt
7.74
□□□□□ -1.17
VAM3
Q12241
ENT4
YLL038C
744 nt
7.73
□□□□□ -1.17
VAM3
Q12241
RTG2
YGL252C
1767 nt
7.72
□□□□□ -1.17
VAM3
Q12241
CWP2
YKL096W-A
279 nt
7.71
□□□□□ -1.18
VAM3
Q12241
AIM1
YAL046C
357 nt
7.71
□□□□□ -1.18
VAM3
Q12241
YLR046C
YLR046C
813 nt
7.71
□□□□□ -1.18
VAM3
Q12241
CSM1
YCR086W
573 nt
7.7
□□□□□ -1.18
First
Previous
5
Next
Last
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 44.5 ms