Protein–RNA interactions for Protein: P38316

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, yeast

Predictions only

Length 186 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG12	P38316	YJL067W	YJL067W	351 nt		9.54	□□□□□ -0.88
ATG12	P38316	SPT20	YOL148C	1815 nt		9.5	□□□□□ -0.89
ATG12	P38316	RDN25-1	RDN25-1	3396 nt		9.5	□□□□□ -0.89
ATG12	P38316	RDN25-2	RDN25-2	3396 nt		9.5	□□□□□ -0.89
ATG12	P38316	MEP3	YPR138C	1470 nt		9.47	□□□□□ -0.89
ATG12	P38316	YJL055W	YJL055W	738 nt		9.47	□□□□□ -0.89
ATG12	P38316	BRR1	YPR057W	1026 nt		9.47	□□□□□ -0.89
ATG12	P38316	YPL251W	YPL251W	303 nt		9.46	□□□□□ -0.9
ATG12	P38316	TOA2	YKL058W	369 nt		9.45	□□□□□ -0.9
ATG12	P38316	LEU9	YOR108W	1815 nt		9.45	□□□□□ -0.9
ATG12	P38316	YMR103C	YMR103C	363 nt		9.44	□□□□□ -0.9
ATG12	P38316	LSB5	YCL034W	1065 nt		9.44	□□□□□ -0.9
ATG12	P38316	UFO1	YML088W	2007 nt		9.43	□□□□□ -0.9
ATG12	P38316	URA6	YKL024C	615 nt		9.41	□□□□□ -0.9
ATG12	P38316	NAP1	YKR048C	1254 nt		9.41	□□□□□ -0.9
ATG12	P38316	SEN2	YLR105C	1134 nt		9.41	□□□□□ -0.9
ATG12	P38316	CSM1	YCR086W	573 nt		9.4	□□□□□ -0.9
ATG12	P38316	CCT5	YJR064W	1689 nt		9.39	□□□□□ -0.91
ATG12	P38316	PAU5	YFL020C	369 nt		9.39	□□□□□ -0.91
ATG12	P38316	NUC1	YJL208C	990 nt		9.39	□□□□□ -0.91
ATG12	P38316	GND2	YGR256W	1479 nt		9.39	□□□□□ -0.91
ATG12	P38316	SSN3	YPL042C	1668 nt		9.37	□□□□□ -0.91
ATG12	P38316	OYE3	YPL171C	1203 nt		9.36	□□□□□ -0.91
ATG12	P38316	RIB7	YBR153W	735 nt		9.36	□□□□□ -0.91
ATG12	P38316	HSL7	YBR133C	2484 nt		9.36	□□□□□ -0.91
ATG12	P38316	RPT5	YOR117W	1305 nt		9.35	□□□□□ -0.91
ATG12	P38316	STP3	YLR375W	1032 nt		9.35	□□□□□ -0.91
ATG12	P38316	TAF13	YML098W	504 nt		9.35	□□□□□ -0.91
ATG12	P38316	SAM2	YDR502C	1155 nt		9.34	□□□□□ -0.91
ATG12	P38316	TRT2	tT(CGU)K	72 nt		9.34	□□□□□ -0.91
ATG12	P38316	YJL118W	YJL118W	660 nt		9.34	□□□□□ -0.91
ATG12	P38316	PGC1	YPL206C	966 nt		9.34	□□□□□ -0.91
ATG12	P38316	YOR325W	YOR325W	474 nt		9.33	□□□□□ -0.92
ATG12	P38316	THI72	YOR192C	1800 nt		9.33	□□□□□ -0.92
ATG12	P38316	PHO23	YNL097C	993 nt		9.32	□□□□□ -0.92
ATG12	P38316	BNI5	YNL166C	1347 nt		9.31	□□□□□ -0.92
ATG12	P38316	CWC15	YDR163W	528 nt		9.31	□□□□□ -0.92
ATG12	P38316	PET8	YNL003C	855 nt		9.31	□□□□□ -0.92
ATG12	P38316	YBR232C	YBR232C	360 nt		9.31	□□□□□ -0.92
ATG12	P38316	GAL3	YDR009W	1563 nt		9.3	□□□□□ -0.92
ATG12	P38316	SEC61	YLR378C	1443 nt		9.3	□□□□□ -0.92
ATG12	P38316	PUP1	YOR157C	786 nt		9.29	□□□□□ -0.92
ATG12	P38316	YIL100C-A	YIL100C-A	339 nt		9.28	□□□□□ -0.92
ATG12	P38316	MSC1	YML128C	1542 nt		9.27	□□□□□ -0.93
ATG12	P38316	ILV3	YJR016C	1758 nt		9.27	□□□□□ -0.93
ATG12	P38316	MUP1	YGR055W	1725 nt		9.26	□□□□□ -0.93
ATG12	P38316	YNL024C	YNL024C	741 nt		9.26	□□□□□ -0.93
ATG12	P38316	HOL1	YNR055C	1761 nt		9.26	□□□□□ -0.93
ATG12	P38316	FLR1	YBR008C	1647 nt		9.25	□□□□□ -0.93
ATG12	P38316	OXA1	YER154W	1209 nt		9.25	□□□□□ -0.93
ATG12	P38316	FMS1	YMR020W	1527 nt		9.25	□□□□□ -0.93
ATG12	P38316	RAS2	YNL098C	969 nt		9.24	□□□□□ -0.93
ATG12	P38316	SAM3	YPL274W	1764 nt		9.24	□□□□□ -0.93
ATG12	P38316	YJL064W	YJL064W	396 nt		9.23	□□□□□ -0.93
ATG12	P38316	SPP2	YOR148C	558 nt		9.23	□□□□□ -0.93
ATG12	P38316	RSC8	YFR037C	1674 nt		9.23	□□□□□ -0.93
ATG12	P38316	ACH1	YBL015W	1581 nt		9.21	□□□□□ -0.93
ATG12	P38316	YER188W	YER188W	720 nt		9.21	□□□□□ -0.94
ATG12	P38316	YMR262W	YMR262W	942 nt		9.21	□□□□□ -0.94
ATG12	P38316	TPS1	YBR126C	1488 nt		9.21	□□□□□ -0.94
ATG12	P38316	OYE2	YHR179W	1203 nt		9.2	□□□□□ -0.94
ATG12	P38316	YPS3	YLR121C	1527 nt		9.2	□□□□□ -0.94
ATG12	P38316	DLD2	YDL178W	1593 nt		9.2	□□□□□ -0.94
ATG12	P38316	CCT2	YIL142W	1584 nt		9.2	□□□□□ -0.94
ATG12	P38316	POT1	YIL160C	1254 nt		9.19	□□□□□ -0.94
ATG12	P38316	SNZ1	YMR096W	894 nt		9.19	□□□□□ -0.94
ATG12	P38316	PAU19	YMR325W	375 nt		9.19	□□□□□ -0.94
ATG12	P38316	MHF1	YOL086W-A	273 nt		9.19	□□□□□ -0.94
ATG12	P38316	FUB1	YCR076C	753 nt		9.18	□□□□□ -0.94
ATG12	P38316	OPI10	YOL032W	741 nt		9.18	□□□□□ -0.94
ATG12	P38316	PAR32	YDL173W	888 nt		9.17	□□□□□ -0.94
ATG12	P38316	GSF2	YML048W	1212 nt		9.17	□□□□□ -0.94
ATG12	P38316	YPR126C	YPR126C	309 nt		9.16	□□□□□ -0.94
ATG12	P38316	IML3	YBR107C	738 nt		9.16	□□□□□ -0.94
ATG12	P38316	HEM13	YDR044W	987 nt		9.14	□□□□□ -0.95
ATG12	P38316	TIM44	YIL022W	1296 nt		9.14	□□□□□ -0.95
ATG12	P38316	EAF3	YPR023C	1206 nt		9.14	□□□□□ -0.95
ATG12	P38316	ARO8	YGL202W	1503 nt		9.14	□□□□□ -0.95
ATG12	P38316	CTI6	YPL181W	1521 nt		9.14	□□□□□ -0.95
ATG12	P38316	RIM8	YGL045W	1629 nt		9.13	□□□□□ -0.95
ATG12	P38316	DAK2	YFL053W	1776 nt		9.13	□□□□□ -0.95
ATG12	P38316	LSB6	YJL100W	1824 nt		9.12	□□□□□ -0.95
ATG12	P38316	COQ8	YGL119W	1506 nt		9.12	□□□□□ -0.95
ATG12	P38316	BET2	YPR176C	978 nt		9.12	□□□□□ -0.95
ATG12	P38316	VPS62	YGR141W	1404 nt		9.12	□□□□□ -0.95
ATG12	P38316	OSH7	YHR001W	1314 nt		9.11	□□□□□ -0.95
ATG12	P38316	TUB4	YLR212C	1422 nt		9.11	□□□□□ -0.95
ATG12	P38316	SLG1	YOR008C	1137 nt		9.09	□□□□□ -0.95
ATG12	P38316	YDL086W	YDL086W	822 nt		9.07	□□□□□ -0.96
ATG12	P38316	TMA23	YMR269W	636 nt		9.07	□□□□□ -0.96
ATG12	P38316	KES1	YPL145C	1305 nt		9.06	□□□□□ -0.96
ATG12	P38316	YGL114W	YGL114W	2178 nt		9.06	□□□□□ -0.96
ATG12	P38316	LSM5	YER146W	282 nt		9.06	□□□□□ -0.96
ATG12	P38316	TIP1	YBR067C	633 nt		9.06	□□□□□ -0.96
ATG12	P38316	SOL2	YCR073W-A	948 nt		9.04	□□□□□ -0.96
ATG12	P38316	DDI1	YER143W	1287 nt		9.04	□□□□□ -0.96
ATG12	P38316	APS2	YJR058C	444 nt		9.04	□□□□□ -0.96
ATG12	P38316	UGP1	YKL035W	1500 nt		9.04	□□□□□ -0.96
ATG12	P38316	SGA1	YIL099W	1650 nt		9.04	□□□□□ -0.96
ATG12	P38316	TAT2	YOL020W	1779 nt		9.03	□□□□□ -0.96

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