Protein–RNA interactions for Protein: P25037

UBP1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, yeastyeast

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Length 809 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBP1P25037 MHF1YOL086W-A 273 nt11.72□□□□□ -0.53
UBP1P25037 UGA4YDL210W 1716 nt11.72□□□□□ -0.53
UBP1P25037 YCL074WYCL074W 927 nt11.7□□□□□ -0.54
UBP1P25037 RIB7YBR153W 735 nt11.66□□□□□ -0.54
UBP1P25037 LSB5YCL034W 1065 nt11.65□□□□□ -0.54
UBP1P25037 YOR343CYOR343C 327 nt11.64□□□□□ -0.55
UBP1P25037 RTN2YDL204W 1182 nt11.63□□□□□ -0.55
UBP1P25037 YOR268CYOR268C 399 nt11.63□□□□□ -0.55
UBP1P25037 MFG1YDL233W 1377 nt11.63□□□□□ -0.55
UBP1P25037 GAL3YDR009W 1563 nt11.62□□□□□ -0.55
UBP1P25037 PLB1YMR008C 1995 nt11.61□□□□□ -0.55
UBP1P25037 YCR025CYCR025C 411 nt11.61□□□□□ -0.55
UBP1P25037 YJL118WYJL118W 660 nt11.61□□□□□ -0.55
UBP1P25037 ACO2YJL200C 2370 nt11.6□□□□□ -0.55
UBP1P25037 SED1YDR077W 1017 nt11.6□□□□□ -0.55
UBP1P25037 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt11.6□□□□□ -0.55
UBP1P25037 HIF1YLL022C 1158 nt11.6□□□□□ -0.55
UBP1P25037 PAU21YOR394W 495 nt11.6□□□□□ -0.55
UBP1P25037 PAU22YPL282C 495 nt11.6□□□□□ -0.55
UBP1P25037 APS2YJR058C 444 nt11.59□□□□□ -0.55
UBP1P25037 SWE1YJL187C 2460 nt11.59□□□□□ -0.55
UBP1P25037 CSM1YCR086W 573 nt11.57□□□□□ -0.56
UBP1P25037 IGD1YFR017C 588 nt11.56□□□□□ -0.56
UBP1P25037 SNZ1YMR096W 894 nt11.56□□□□□ -0.56
UBP1P25037 RCR1YBR005W 642 nt11.55□□□□□ -0.56
UBP1P25037 SWM1YDR260C 513 nt11.54□□□□□ -0.56
UBP1P25037 YMR007WYMR007W 381 nt11.54□□□□□ -0.56
UBP1P25037 RPT5YOR117W 1305 nt11.54□□□□□ -0.56
UBP1P25037 YPR126CYPR126C 309 nt11.53□□□□□ -0.56
UBP1P25037 HOG1YLR113W 1308 nt11.53□□□□□ -0.56
UBP1P25037 CTI6YPL181W 1521 nt11.5□□□□□ -0.57
UBP1P25037 UTR1YJR049C 1593 nt11.5□□□□□ -0.57
UBP1P25037 NIF3YGL221C 867 nt11.5□□□□□ -0.57
UBP1P25037 NUC1YJL208C 990 nt11.5□□□□□ -0.57
UBP1P25037 IPL1YPL209C 1104 nt11.5□□□□□ -0.57
UBP1P25037 ARO7YPR060C 771 nt11.5□□□□□ -0.57
UBP1P25037 IML3YBR107C 738 nt11.5□□□□□ -0.57
UBP1P25037 SAM35YHR083W 990 nt11.49□□□□□ -0.57
UBP1P25037 YER190C-AYER190C-A 576 nt11.47□□□□□ -0.57
UBP1P25037 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt11.47□□□□□ -0.57
UBP1P25037 YML133W-AYML133W-A 576 nt11.47□□□□□ -0.57
UBP1P25037 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt11.47□□□□□ -0.57
UBP1P25037 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt11.47□□□□□ -0.57
UBP1P25037 HRA1HRA1 564 nt11.46□□□□□ -0.57
UBP1P25037 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt11.45□□□□□ -0.58
UBP1P25037 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt11.45□□□□□ -0.58
UBP1P25037 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt11.45□□□□□ -0.58
UBP1P25037 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt11.45□□□□□ -0.58
UBP1P25037 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt11.45□□□□□ -0.58
UBP1P25037 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt11.45□□□□□ -0.58
UBP1P25037 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt11.45□□□□□ -0.58
UBP1P25037 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt11.45□□□□□ -0.58
UBP1P25037 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt11.45□□□□□ -0.58
UBP1P25037 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt11.45□□□□□ -0.58
UBP1P25037 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt11.45□□□□□ -0.58
UBP1P25037 LYS20YDL182W 1287 nt11.43□□□□□ -0.58
UBP1P25037 LIP1YMR298W 453 nt11.43□□□□□ -0.58
UBP1P25037 MEP3YPR138C 1470 nt11.41□□□□□ -0.58
UBP1P25037 YNL024CYNL024C 741 nt11.4□□□□□ -0.58
UBP1P25037 DAK2YFL053W 1776 nt11.39□□□□□ -0.59
UBP1P25037 YPL251WYPL251W 303 nt11.38□□□□□ -0.59
UBP1P25037 MET8YBR213W 825 nt11.38□□□□□ -0.59
UBP1P25037 YGR259CYGR259C 441 nt11.37□□□□□ -0.59
UBP1P25037 SAM3YPL274W 1764 nt11.36□□□□□ -0.59
UBP1P25037 MCH5YOR306C 1566 nt11.36□□□□□ -0.59
UBP1P25037 SSN3YPL042C 1668 nt11.34□□□□□ -0.59
UBP1P25037 YMR103CYMR103C 363 nt11.34□□□□□ -0.59
UBP1P25037 PHO23YNL097C 993 nt11.34□□□□□ -0.59
UBP1P25037 OYE3YPL171C 1203 nt11.34□□□□□ -0.59
UBP1P25037 YMR206WYMR206W 942 nt11.32□□□□□ -0.6
UBP1P25037 GRH1YDR517W 1119 nt11.31□□□□□ -0.6
UBP1P25037 BRR1YPR057W 1026 nt11.31□□□□□ -0.6
UBP1P25037 EDC2YER035W 438 nt11.3□□□□□ -0.6
UBP1P25037 FLX1YIL134W 936 nt11.3□□□□□ -0.6
UBP1P25037 IRC24YIR036C 792 nt11.29□□□□□ -0.6
UBP1P25037 ALG12YNR030W 1656 nt11.28□□□□□ -0.6
UBP1P25037 FUR4YBR021W 1902 nt11.28□□□□□ -0.6
UBP1P25037 TPS1YBR126C 1488 nt11.27□□□□□ -0.6
UBP1P25037 BNI5YNL166C 1347 nt11.27□□□□□ -0.61
UBP1P25037 LEU9YOR108W 1815 nt11.26□□□□□ -0.61
UBP1P25037 OYE2YHR179W 1203 nt11.26□□□□□ -0.61
UBP1P25037 TOA2YKL058W 369 nt11.26□□□□□ -0.61
UBP1P25037 MSC1YML128C 1542 nt11.25□□□□□ -0.61
UBP1P25037 SER2YGR208W 930 nt11.24□□□□□ -0.61
UBP1P25037 PCP1YGR101W 1041 nt11.23□□□□□ -0.61
UBP1P25037 CDD1YLR245C 429 nt11.22□□□□□ -0.61
UBP1P25037 YBL086CYBL086C 1401 nt11.2□□□□□ -0.62
UBP1P25037 HTS1YPR033C 1641 nt11.2□□□□□ -0.62
UBP1P25037 SDH8YBR269C 417 nt11.18□□□□□ -0.62
UBP1P25037 NAS2YIL007C 663 nt11.17□□□□□ -0.62
UBP1P25037 RAS2YNL098C 969 nt11.17□□□□□ -0.62
UBP1P25037 SEC61YLR378C 1443 nt11.17□□□□□ -0.62
UBP1P25037 HXT1YHR094C 1713 nt11.16□□□□□ -0.62
UBP1P25037 TRT2tT(CGU)K 72 nt11.16□□□□□ -0.62
UBP1P25037 DBP1YPL119C 1854 nt11.16□□□□□ -0.62
UBP1P25037 PRP4YPR178W 1398 nt11.16□□□□□ -0.62
UBP1P25037 CYC3YAL039C 810 nt11.15□□□□□ -0.62
UBP1P25037 SPS100YHR139C 981 nt11.14□□□□□ -0.63
UBP1P25037 THP3YPR045C 1413 nt11.13□□□□□ -0.63
UBP1P25037 SAM2YDR502C 1155 nt11.13□□□□□ -0.63
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