Protein–RNA interactions for Protein: P23396

RPS3, 40S ribosomal protein S3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3P23396 SUPT16H-207ENST00000557394 2324 ntTSL 210.1□□□□□ -0.798e-8■■■■■ 53.9
RPS3P23396 NDUFB9-205ENST00000518657 672 ntTSL 28.12□□□□□ -1.113e-9■■■■■ 53.8
RPS3P23396 VWCE-206ENST00000538438 1076 ntTSL 315.51■□□□□ 0.078e-7■■■■■ 53.5
RPS3P23396 ATP5A1-216ENST00000591267 460 ntTSL 520.76■□□□□ 0.914e-9■■■■■ 53.5
RPS3P23396 ATP5A1-207ENST00000588390 556 ntTSL 1 (best)18.79■□□□□ 0.64e-9■■■■■ 53.5
RPS3P23396 COX7A2-208ENST00000509698 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.768e-9■■■■■ 53.3
RPS3P23396 COX7A2-202ENST00000370089 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.038e-9■■■■■ 53.3
RPS3P23396 COX7A2-201ENST00000370081 914 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.18e-9■■■■■ 53.3
RPS3P23396 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.88e-9■■■■■ 53.3
RPS3P23396 COX7A2-204ENST00000459637 501 ntTSL 22.23□□□□□ -2.058e-9■■■■■ 53.3
RPS3P23396 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC-1.81□□□□□ -2.78e-9■■■■■ 53.3
RPS3P23396 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC3.56□□□□□ -1.848e-8■■■■■ 53.1
RPS3P23396 NDUFA4-201ENST00000339600 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.282e-7■■■■■ 53
RPS3P23396 PIH1D1-216ENST00000598889 615 ntTSL 518.27■□□□□ 0.529e-7■■■■■ 52.9
RPS3P23396 PIH1D1-221ENST00000601807 998 ntTSL 517.2■□□□□ 0.349e-7■■■■■ 52.9
RPS3P23396 PIH1D1-224ENST00000602226 341 ntTSL 316.73■□□□□ 0.279e-7■■■■■ 52.9
RPS3P23396 PIH1D1-204ENST00000594845 489 ntTSL 516.73■□□□□ 0.279e-7■■■■■ 52.9
RPS3P23396 PIH1D1-202ENST00000593629 1084 ntTSL 316.73■□□□□ 0.279e-7■■■■■ 52.9
RPS3P23396 PIH1D1-210ENST00000596651 741 ntTSL 316.73■□□□□ 0.279e-7■■■■■ 52.9
RPS3P23396 PIH1D1-214ENST00000597577 698 ntTSL 516.73■□□□□ 0.279e-7■■■■■ 52.9
RPS3P23396 PIH1D1-212ENST00000596916 793 ntTSL 515.11■□□□□ 0.019e-7■■■■■ 52.9
RPS3P23396 PIH1D1-215ENST00000598175 418 ntTSL 515.11■□□□□ 0.019e-7■■■■■ 52.9
RPS3P23396 PIH1D1-208ENST00000595633 424 ntTSL 214.41□□□□□ -0.19e-7■■■■■ 52.9
RPS3P23396 PIH1D1-219ENST00000600875 633 ntTSL 512.92□□□□□ -0.349e-7■■■■■ 52.9
RPS3P23396 HSPE1-205ENST00000465573 639 ntTSL 218.65■□□□□ 0.582e-16■■■■■ 52.8
RPS3P23396 HSPE1-204ENST00000463841 700 ntTSL 23.01□□□□□ -1.932e-16■■■■■ 52.8
RPS3P23396 APOL1-207ENST00000427990 624 ntTSL 311.33□□□□□ -0.61e-7■■■■■ 52.6
RPS3P23396 PEF1-207ENST00000492061 936 ntTSL 318.16■□□□□ 0.51e-9■■■■■ 52.2
RPS3P23396 KLHL21-205ENST00000496707 824 ntTSL 1 (best)16.73■□□□□ 0.271e-9■■■■■ 52.2
RPS3P23396 ANAPC5-210ENST00000536416 677 ntTSL 316.16■□□□□ 0.181e-9■■■■■ 52.2
RPS3P23396 NANS-205ENST00000480925 649 ntTSL 215.53■□□□□ 0.082e-18■■■■■ 52.2
RPS3P23396 ANAPC5-211ENST00000536837 509 ntTSL 415.4■□□□□ 0.061e-9■■■■■ 52.2
RPS3P23396 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.011e-9■■■■■ 52.2
RPS3P23396 PEF1-204ENST00000472443 687 ntTSL 314.88□□□□□ -0.031e-9■■■■■ 52.2
RPS3P23396 PEF1-206ENST00000489164 865 ntTSL 514.88□□□□□ -0.031e-9■■■■■ 52.2
RPS3P23396 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.081e-9■■■■■ 52.2
RPS3P23396 ANAPC5-220ENST00000544442 915 ntTSL 513.4□□□□□ -0.261e-9■■■■■ 52.2
RPS3P23396 PEF1-208ENST00000496805 742 ntTSL 512.7□□□□□ -0.381e-9■■■■■ 52.2
RPS3P23396 ANAPC5-216ENST00000539871 704 ntTSL 512.13□□□□□ -0.471e-9■■■■■ 52.2
RPS3P23396 PEF1-205ENST00000478502 750 ntTSL 29.87□□□□□ -0.831e-9■■■■■ 52.2
RPS3P23396 PEF1-203ENST00000471219 401 ntTSL 38.83□□□□□ -11e-9■■■■■ 52.2
RPS3P23396 ANAPC5-218ENST00000541887 2400 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.051e-9■■■■■ 52.2
RPS3P23396 NDUFV2-202ENST00000400033 942 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.232e-12■■■■■ 52.2
RPS3P23396 MRPL27-207ENST00000514928 397 ntTSL 26.79□□□□□ -1.321e-9■■■■■ 52.2
RPS3P23396 NDUFV2-203ENST00000465096 643 ntTSL 25.46□□□□□ -1.542e-12■■■■■ 52.2
RPS3P23396 NDUFV2-205ENST00000474740 264 ntTSL 22.44□□□□□ -2.022e-12■■■■■ 52.2
RPS3P23396 HSPE1-207ENST00000495200 537 ntTSL 317.71■□□□□ 0.432e-16■■■■■ 52.1
RPS3P23396 NDUFA4-202ENST00000463308 288 ntTSL 20.39□□□□□ -2.359e-10■■■■■ 52.1
RPS3P23396 PAPSS1-201ENST00000265174 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.622e-7■■■■■ 51.9
RPS3P23396 RRM1-208ENST00000530368 332 ntTSL 50.53□□□□□ -2.321e-6■■■■■ 51.9
RPS3P23396 RTCB-204ENST00000485373 564 ntTSL 48.97□□□□□ -0.973e-7■■■■■ 51.8
RPS3P23396 RTCB-205ENST00000487704 767 ntTSL 26.83□□□□□ -1.323e-7■■■■■ 51.8
RPS3P23396 RTCB-203ENST00000476619 594 ntTSL 46.5□□□□□ -1.373e-7■■■■■ 51.8
RPS3P23396 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.362e-11■■■■■ 51.7
RPS3P23396 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.392e-9■■■■■ 51.6
RPS3P23396 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.512e-9■■■■■ 51.6
RPS3P23396 LPCAT3-207ENST00000538910 571 ntTSL 518.92■□□□□ 0.629e-9■■■■■ 51.5
RPS3P23396 LPCAT3-205ENST00000536971 564 ntTSL 418.92■□□□□ 0.629e-9■■■■■ 51.5
RPS3P23396 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.433e-26■■■■■ 51.4
RPS3P23396 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.048e-10■■■■■ 51.3
RPS3P23396 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.645e-8■■■■■ 51.3
RPS3P23396 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.355e-8■■■■■ 51.3
RPS3P23396 ANGPTL4-203ENST00000593998 1798 ntTSL 1 (best)16.42■□□□□ 0.225e-8■■■■■ 51.3
RPS3P23396 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.198e-10■■■■■ 51.3
RPS3P23396 SAP30-202ENST00000504618 410 ntTSL 316.15■□□□□ 0.188e-10■■■■■ 51.3
RPS3P23396 ANGPTL4-206ENST00000595079 1719 ntTSL 216.06■□□□□ 0.165e-8■■■■■ 51.3
RPS3P23396 TBL2-219ENST00000488915 708 ntTSL 214.29□□□□□ -0.128e-10■■■■■ 51.3
RPS3P23396 TBL2-213ENST00000459913 2358 ntTSL 513.79□□□□□ -0.28e-10■■■■■ 51.3
RPS3P23396 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -29e-7■■■■■ 51.1
RPS3P23396 CLIC2-204ENST00000491205 516 ntTSL 21.07□□□□□ -2.249e-7■■■■■ 50.8
RPS3P23396 MCM2-205ENST00000473785 684 ntTSL 213.9□□□□□ -0.183e-7■■■■■ 50.7
RPS3P23396 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.511e-7■■■■■ 50.7
RPS3P23396 IRAK1-201ENST00000369973 2358 ntTSL 523.84■■□□□ 1.414e-9■■■■■ 50.7
RPS3P23396 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.232e-9■■■■■ 50.7
RPS3P23396 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.762e-9■■■■■ 50.7
RPS3P23396 BOP1-202ENST00000568812 878 ntTSL 519.69■□□□□ 0.741e-7■■■■■ 50.7
RPS3P23396 JMJD6-204ENST00000542934 1898 ntTSL 218.15■□□□□ 0.51e-7■■■■■ 50.7
RPS3P23396 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.471e-7■■■■■ 50.7
RPS3P23396 JMJD6-201ENST00000303996 1893 ntTSL 217.75■□□□□ 0.431e-7■■■■■ 50.7
RPS3P23396 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.381e-7■■■■■ 50.7
RPS3P23396 IRAK1-208ENST00000444230 1125 ntTSL 516.61■□□□□ 0.251e-7■■■■■ 50.7
RPS3P23396 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.221e-7■■■■■ 50.7
RPS3P23396 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.171e-7■■■■■ 50.7
RPS3P23396 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.161e-7■■■■■ 50.7
RPS3P23396 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.053e-9■■■■■ 50.7
RPS3P23396 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -01e-7■■■■■ 50.7
RPS3P23396 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.034e-9■■■■■ 50.7
RPS3P23396 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.041e-7■■■■■ 50.7
RPS3P23396 SNRNP200-205ENST00000480835 540 ntTSL 214.71□□□□□ -0.051e-7■■■■■ 50.7
RPS3P23396 TRAPPC1-207ENST00000575639 561 ntTSL 214.65□□□□□ -0.061e-7■■■■■ 50.7
RPS3P23396 SCAMP3-208ENST00000490999 1011 ntTSL 214.37□□□□□ -0.111e-7■■■■■ 50.7
RPS3P23396 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.131e-7■■■■■ 50.7
RPS3P23396 IRAK1-207ENST00000443220 1175 ntTSL 213.98□□□□□ -0.171e-7■■■■■ 50.7
RPS3P23396 AP1B1-209ENST00000472057 727 ntTSL 313.56□□□□□ -0.241e-7■■■■■ 50.7
RPS3P23396 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.241e-7■■■■■ 50.7
RPS3P23396 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.251e-7■■■■■ 50.7
RPS3P23396 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.251e-7■■■■■ 50.7
RPS3P23396 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.261e-7■■■■■ 50.7
RPS3P23396 RHD-208ENST00000564398 1441 ntTSL 1 (best)13.41□□□□□ -0.261e-7■■■■■ 50.7
RPS3P23396 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.281e-7■■■■■ 50.7
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