Protein–RNA interactions for Protein: P12259

F5, Coagulation factor V, humanhuman

Predictions only

Length 2,224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F5P12259 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
F5P12259 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
F5P12259 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
F5P12259 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
F5P12259 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
F5P12259 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
F5P12259 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
F5P12259 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
F5P12259 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
F5P12259 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
F5P12259 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
F5P12259 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.57■■■□□ 2
F5P12259 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
F5P12259 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
F5P12259 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
F5P12259 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
F5P12259 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
F5P12259 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.54■■■□□ 2
F5P12259 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
F5P12259 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
F5P12259 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
F5P12259 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
F5P12259 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
F5P12259 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
F5P12259 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
F5P12259 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.52■■■□□ 2
F5P12259 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
F5P12259 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
F5P12259 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
F5P12259 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
F5P12259 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
F5P12259 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
F5P12259 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
F5P12259 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
F5P12259 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
F5P12259 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
F5P12259 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
F5P12259 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
F5P12259 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
F5P12259 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
F5P12259 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
F5P12259 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
F5P12259 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
F5P12259 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
F5P12259 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
F5P12259 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
F5P12259 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
F5P12259 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
F5P12259 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
F5P12259 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
F5P12259 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
F5P12259 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
F5P12259 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
F5P12259 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
F5P12259 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
F5P12259 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
F5P12259 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
F5P12259 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
F5P12259 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
F5P12259 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
F5P12259 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
F5P12259 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
F5P12259 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
F5P12259 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
F5P12259 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
F5P12259 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
F5P12259 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
F5P12259 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
F5P12259 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
F5P12259 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
F5P12259 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
F5P12259 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
F5P12259 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
F5P12259 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
F5P12259 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
F5P12259 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
F5P12259 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
F5P12259 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
F5P12259 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
F5P12259 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
F5P12259 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
F5P12259 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
F5P12259 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
F5P12259 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
F5P12259 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
F5P12259 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
F5P12259 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
F5P12259 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
F5P12259 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
F5P12259 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
F5P12259 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
F5P12259 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
F5P12259 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
F5P12259 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
F5P12259 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
F5P12259 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
F5P12259 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
F5P12259 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
F5P12259 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
F5P12259 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.5 ms