Protein–RNA interactions for Protein: P0CX38

RPS6B, 40S ribosomal protein S6-B, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPS6BP0CX38 GND2YGR256W 1479 nt10.28□□□□□ -0.76
RPS6BP0CX38 CAB5YDR196C 726 nt10.27□□□□□ -0.77
RPS6BP0CX38 SDH5YOL071W 489 nt10.27□□□□□ -0.77
RPS6BP0CX38 UGA4YDL210W 1716 nt10.27□□□□□ -0.77
RPS6BP0CX38 OYE3YPL171C 1203 nt10.25□□□□□ -0.77
RPS6BP0CX38 MEP3YPR138C 1470 nt10.24□□□□□ -0.77
RPS6BP0CX38 COG1YGL223C 1254 nt10.23□□□□□ -0.77
RPS6BP0CX38 TRT2tT(CGU)K 72 nt10.23□□□□□ -0.77
RPS6BP0CX38 YOR325WYOR325W 474 nt10.23□□□□□ -0.77
RPS6BP0CX38 YPL041CYPL041C 624 nt10.23□□□□□ -0.77
RPS6BP0CX38 HMT1YBR034C 1047 nt10.22□□□□□ -0.77
RPS6BP0CX38 YHM2YMR241W 945 nt10.21□□□□□ -0.77
RPS6BP0CX38 GLR1YPL091W 1452 nt10.21□□□□□ -0.78
RPS6BP0CX38 ARP10YDR106W 855 nt10.2□□□□□ -0.78
RPS6BP0CX38 FTH1YBR207W 1398 nt10.19□□□□□ -0.78
RPS6BP0CX38 PET8YNL003C 855 nt10.18□□□□□ -0.78
RPS6BP0CX38 FLR1YBR008C 1647 nt10.18□□□□□ -0.78
RPS6BP0CX38 HOL1YNR055C 1761 nt10.17□□□□□ -0.78
RPS6BP0CX38 CWC15YDR163W 528 nt10.17□□□□□ -0.78
RPS6BP0CX38 RPM1RPM1 483 nt10.16□□□□□ -0.78
RPS6BP0CX38 FMS1YMR020W 1527 nt10.16□□□□□ -0.78
RPS6BP0CX38 ILV3YJR016C 1758 nt10.16□□□□□ -0.78
RPS6BP0CX38 UTP6YDR449C 1323 nt10.15□□□□□ -0.78
RPS6BP0CX38 FCY21YER060W 1587 nt10.15□□□□□ -0.78
RPS6BP0CX38 YMR244WYMR244W 1068 nt10.15□□□□□ -0.78
RPS6BP0CX38 ACH1YBL015W 1581 nt10.14□□□□□ -0.79
RPS6BP0CX38 MUP1YGR055W 1725 nt10.14□□□□□ -0.79
RPS6BP0CX38 RAD23YEL037C 1197 nt10.14□□□□□ -0.79
RPS6BP0CX38 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt10.14□□□□□ -0.79
RPS6BP0CX38 FRE6YLL051C 2139 nt10.13□□□□□ -0.79
RPS6BP0CX38 YNL024CYNL024C 741 nt10.12□□□□□ -0.79
RPS6BP0CX38 YPL071CYPL071C 471 nt10.12□□□□□ -0.79
RPS6BP0CX38 SSN3YPL042C 1668 nt10.12□□□□□ -0.79
RPS6BP0CX38 SPP2YOR148C 558 nt10.11□□□□□ -0.79
RPS6BP0CX38 RSC8YFR037C 1674 nt10.11□□□□□ -0.79
RPS6BP0CX38 DLD2YDL178W 1593 nt10.1□□□□□ -0.79
RPS6BP0CX38 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt10.1□□□□□ -0.79
RPS6BP0CX38 YPS3YLR121C 1527 nt10.1□□□□□ -0.79
RPS6BP0CX38 BNI5YNL166C 1347 nt10.09□□□□□ -0.79
RPS6BP0CX38 SAM2YDR502C 1155 nt10.09□□□□□ -0.79
RPS6BP0CX38 RIB3YDR487C 627 nt10.08□□□□□ -0.8
RPS6BP0CX38 YLR111WYLR111W 333 nt10.08□□□□□ -0.8
RPS6BP0CX38 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt10.08□□□□□ -0.8
RPS6BP0CX38 CCT2YIL142W 1584 nt10.07□□□□□ -0.8
RPS6BP0CX38 CSM1YCR086W 573 nt10.06□□□□□ -0.8
RPS6BP0CX38 SEM1YDR363W-A 270 nt10.06□□□□□ -0.8
RPS6BP0CX38 APT2YDR441C 546 nt10.06□□□□□ -0.8
RPS6BP0CX38 SMM1YNR015W 1155 nt10.06□□□□□ -0.8
RPS6BP0CX38 HEM13YDR044W 987 nt10.05□□□□□ -0.8
RPS6BP0CX38 YDR509WYDR509W 348 nt10.05□□□□□ -0.8
RPS6BP0CX38 OXA1YER154W 1209 nt10.05□□□□□ -0.8
RPS6BP0CX38 PRY1YJL079C 900 nt10.05□□□□□ -0.8
RPS6BP0CX38 OPI10YOL032W 741 nt10.05□□□□□ -0.8
RPS6BP0CX38 SEC61YLR378C 1443 nt10.05□□□□□ -0.8
RPS6BP0CX38 LSB6YJL100W 1824 nt10.05□□□□□ -0.8
RPS6BP0CX38 YTH1YPR107C 627 nt10.04□□□□□ -0.8
RPS6BP0CX38 MSC1YML128C 1542 nt10.03□□□□□ -0.8
RPS6BP0CX38 PHO23YNL097C 993 nt10.03□□□□□ -0.8
RPS6BP0CX38 GND1YHR183W 1470 nt10.03□□□□□ -0.8
RPS6BP0CX38 ARO8YGL202W 1503 nt10.02□□□□□ -0.8
RPS6BP0CX38 FUB1YCR076C 753 nt10.02□□□□□ -0.81
RPS6BP0CX38 RIM8YGL045W 1629 nt10□□□□□ -0.81
RPS6BP0CX38 COQ8YGL119W 1506 nt9.99□□□□□ -0.81
RPS6BP0CX38 YER188WYER188W 720 nt9.99□□□□□ -0.81
RPS6BP0CX38 LOT5YKL183W 921 nt9.99□□□□□ -0.81
RPS6BP0CX38 SAM3YPL274W 1764 nt9.98□□□□□ -0.81
RPS6BP0CX38 Q0144Q0144 330 nt9.98□□□□□ -0.81
RPS6BP0CX38 YMR226CYMR226C 804 nt9.98□□□□□ -0.81
RPS6BP0CX38 BET2YPR176C 978 nt9.97□□□□□ -0.81
RPS6BP0CX38 BNS1YGR230W 414 nt9.95□□□□□ -0.82
RPS6BP0CX38 VPS62YGR141W 1404 nt9.95□□□□□ -0.82
RPS6BP0CX38 TAT2YOL020W 1779 nt9.95□□□□□ -0.82
RPS6BP0CX38 YGL114WYGL114W 2178 nt9.94□□□□□ -0.82
RPS6BP0CX38 RBG2YGR173W 1107 nt9.94□□□□□ -0.82
RPS6BP0CX38 KES1YPL145C 1305 nt9.93□□□□□ -0.82
RPS6BP0CX38 UGP1YKL035W 1500 nt9.92□□□□□ -0.82
RPS6BP0CX38 ZAP1YJL056C 2643 nt9.92□□□□□ -0.82
RPS6BP0CX38 YJL055WYJL055W 738 nt9.92□□□□□ -0.82
RPS6BP0CX38 SGA1YIL099W 1650 nt9.91□□□□□ -0.82
RPS6BP0CX38 YDL086WYDL086W 822 nt9.91□□□□□ -0.82
RPS6BP0CX38 SKG1YKR100C 1068 nt9.91□□□□□ -0.82
RPS6BP0CX38 NUC1YJL208C 990 nt9.9□□□□□ -0.82
RPS6BP0CX38 RAS2YNL098C 969 nt9.9□□□□□ -0.82
RPS6BP0CX38 OSH7YHR001W 1314 nt9.89□□□□□ -0.83
RPS6BP0CX38 QDR2YIL121W 1629 nt9.87□□□□□ -0.83
RPS6BP0CX38 PUS5YLR165C 765 nt9.87□□□□□ -0.83
RPS6BP0CX38 REC114YMR133W 1287 nt9.87□□□□□ -0.83
RPS6BP0CX38 LSB5YCL034W 1065 nt9.87□□□□□ -0.83
RPS6BP0CX38 LSB3YFR024C-A 1380 nt9.87□□□□□ -0.83
RPS6BP0CX38 HXT12YIL170W 1374 nt9.87□□□□□ -0.83
RPS6BP0CX38 SOL2YCR073W-A 948 nt9.86□□□□□ -0.83
RPS6BP0CX38 RPT5YOR117W 1305 nt9.85□□□□□ -0.83
RPS6BP0CX38 YDR455CYDR455C 309 nt9.85□□□□□ -0.83
RPS6BP0CX38 VRG4YGL225W 1014 nt9.85□□□□□ -0.83
RPS6BP0CX38 FAF1YIL019W 1041 nt9.85□□□□□ -0.83
RPS6BP0CX38 PET20YPL159C 762 nt9.85□□□□□ -0.83
RPS6BP0CX38 EAF3YPR023C 1206 nt9.85□□□□□ -0.83
RPS6BP0CX38 RIB2YOL066C 1776 nt9.85□□□□□ -0.83
RPS6BP0CX38 TPS1YBR126C 1488 nt9.84□□□□□ -0.83
RPS6BP0CX38 HEL2YDR266C 1920 nt9.82□□□□□ -0.84
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