Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CGGBP1Q9UFW8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CGGBP1Q9UFW8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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