Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVZ3

NECAP2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAP2Q9NVZ3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NECAP2Q9NVZ3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NECAP2Q9NVZ3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NECAP2Q9NVZ3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NECAP2Q9NVZ3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NECAP2Q9NVZ3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NECAP2Q9NVZ3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NECAP2Q9NVZ3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NECAP2Q9NVZ3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NECAP2Q9NVZ3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NECAP2Q9NVZ3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NECAP2Q9NVZ3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NECAP2Q9NVZ3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NECAP2Q9NVZ3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NECAP2Q9NVZ3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NECAP2Q9NVZ3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NECAP2Q9NVZ3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NECAP2Q9NVZ3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NECAP2Q9NVZ3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NECAP2Q9NVZ3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NECAP2Q9NVZ3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NECAP2Q9NVZ3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NECAP2Q9NVZ3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NECAP2Q9NVZ3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NECAP2Q9NVZ3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NECAP2Q9NVZ3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NECAP2Q9NVZ3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NECAP2Q9NVZ3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NECAP2Q9NVZ3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NECAP2Q9NVZ3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NECAP2Q9NVZ3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NECAP2Q9NVZ3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NECAP2Q9NVZ3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NECAP2Q9NVZ3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NECAP2Q9NVZ3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NECAP2Q9NVZ3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NECAP2Q9NVZ3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NECAP2Q9NVZ3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NECAP2Q9NVZ3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NECAP2Q9NVZ3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NECAP2Q9NVZ3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NECAP2Q9NVZ3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NECAP2Q9NVZ3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NECAP2Q9NVZ3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NECAP2Q9NVZ3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NECAP2Q9NVZ3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NECAP2Q9NVZ3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NECAP2Q9NVZ3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NECAP2Q9NVZ3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms