Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ3

USP30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP30Q70CQ3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
USP30Q70CQ3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
USP30Q70CQ3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
USP30Q70CQ3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.4 ms