Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUR7

ANKRD20A3, Ankyrin repeat domain-containing protein 20A3, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD20A3Q5VUR7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ANKRD20A3Q5VUR7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD20A3Q5VUR7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD20A3Q5VUR7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD20A3Q5VUR7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD20A3Q5VUR7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD20A3Q5VUR7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD20A3Q5VUR7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD20A3Q5VUR7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD20A3Q5VUR7 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD20A3Q5VUR7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD20A3Q5VUR7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD20A3Q5VUR7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ANKRD20A3Q5VUR7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD20A3Q5VUR7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD20A3Q5VUR7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD20A3Q5VUR7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD20A3Q5VUR7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD20A3Q5VUR7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD20A3Q5VUR7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD20A3Q5VUR7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD20A3Q5VUR7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD20A3Q5VUR7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD20A3Q5VUR7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD20A3Q5VUR7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD20A3Q5VUR7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD20A3Q5VUR7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ANKRD20A3Q5VUR7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD20A3Q5VUR7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD20A3Q5VUR7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD20A3Q5VUR7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD20A3Q5VUR7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD20A3Q5VUR7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD20A3Q5VUR7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD20A3Q5VUR7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD20A3Q5VUR7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD20A3Q5VUR7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD20A3Q5VUR7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD20A3Q5VUR7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD20A3Q5VUR7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD20A3Q5VUR7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD20A3Q5VUR7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD20A3Q5VUR7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ANKRD20A3Q5VUR7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD20A3Q5VUR7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD20A3Q5VUR7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD20A3Q5VUR7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD20A3Q5VUR7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD20A3Q5VUR7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD20A3Q5VUR7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD20A3Q5VUR7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD20A3Q5VUR7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD20A3Q5VUR7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD20A3Q5VUR7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD20A3Q5VUR7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ANKRD20A3Q5VUR7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms