Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
COL24A1Q17RW2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL24A1Q17RW2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL24A1Q17RW2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL24A1Q17RW2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL24A1Q17RW2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL24A1Q17RW2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL24A1Q17RW2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL24A1Q17RW2 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL24A1Q17RW2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL24A1Q17RW2 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
COL24A1Q17RW2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL24A1Q17RW2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL24A1Q17RW2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL24A1Q17RW2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL24A1Q17RW2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL24A1Q17RW2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL24A1Q17RW2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL24A1Q17RW2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL24A1Q17RW2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL24A1Q17RW2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL24A1Q17RW2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL24A1Q17RW2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL24A1Q17RW2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL24A1Q17RW2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
COL24A1Q17RW2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL24A1Q17RW2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL24A1Q17RW2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL24A1Q17RW2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL24A1Q17RW2 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
COL24A1Q17RW2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
COL24A1Q17RW2 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL24A1Q17RW2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL24A1Q17RW2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL24A1Q17RW2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
COL24A1Q17RW2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL24A1Q17RW2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
COL24A1Q17RW2 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL24A1Q17RW2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL24A1Q17RW2 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL24A1Q17RW2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL24A1Q17RW2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL24A1Q17RW2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL24A1Q17RW2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL24A1Q17RW2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL24A1Q17RW2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL24A1Q17RW2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
COL24A1Q17RW2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
COL24A1Q17RW2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
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