Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIGQ13278 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIGQ13278 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIGQ13278 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIGQ13278 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIGQ13278 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIGQ13278 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIGQ13278 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIGQ13278 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIGQ13278 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RIGQ13278 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIGQ13278 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIGQ13278 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIGQ13278 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIGQ13278 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIGQ13278 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIGQ13278 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RIGQ13278 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIGQ13278 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIGQ13278 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIGQ13278 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIGQ13278 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIGQ13278 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIGQ13278 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIGQ13278 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIGQ13278 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIGQ13278 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIGQ13278 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIGQ13278 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIGQ13278 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIGQ13278 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIGQ13278 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIGQ13278 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIGQ13278 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIGQ13278 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIGQ13278 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIGQ13278 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIGQ13278 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIGQ13278 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIGQ13278 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RIGQ13278 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIGQ13278 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIGQ13278 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RIGQ13278 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIGQ13278 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIGQ13278 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIGQ13278 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIGQ13278 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIGQ13278 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIGQ13278 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIGQ13278 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIGQ13278 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIGQ13278 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIGQ13278 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIGQ13278 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RIGQ13278 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIGQ13278 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIGQ13278 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIGQ13278 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIGQ13278 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIGQ13278 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIGQ13278 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIGQ13278 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIGQ13278 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIGQ13278 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIGQ13278 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIGQ13278 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIGQ13278 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIGQ13278 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIGQ13278 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIGQ13278 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIGQ13278 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIGQ13278 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIGQ13278 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIGQ13278 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIGQ13278 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIGQ13278 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIGQ13278 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIGQ13278 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIGQ13278 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIGQ13278 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIGQ13278 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIGQ13278 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIGQ13278 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIGQ13278 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIGQ13278 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIGQ13278 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIGQ13278 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIGQ13278 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIGQ13278 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIGQ13278 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIGQ13278 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIGQ13278 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIGQ13278 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIGQ13278 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIGQ13278 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIGQ13278 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIGQ13278 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIGQ13278 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIGQ13278 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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