Protein–RNA interactions for Protein: Q12417

PRP46, Pre-mRNA-splicing factor PRP46, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP46Q12417 CTP1YBR291C 900 nt2.7□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 SKO1YNL167C 1944 nt2.7□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 YDR034C-CYDR034C-C 1317 nt2.69□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 YLR410W-AYLR410W-A 1317 nt2.69□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 YKL222CYKL222C 2118 nt2.69□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 VHR2YER064C 1518 nt2.69□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 HEH2YDR458C 1992 nt2.69□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 POL4YCR014C 1749 nt2.69□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 SKP2YNL311C 2292 nt2.69□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 DAD2YKR083C 402 nt2.69□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 GRX7YBR014C 612 nt2.69□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 MCA1YOR197W 1299 nt2.69□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 SRL1YOR247W 633 nt2.69□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 YOR387CYOR387C 621 nt2.69□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 CCL1YPR025C 1182 nt2.69□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 YPR027CYPR027C 834 nt2.69□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 YDR210W-BYDR210W-B 5313 nt2.69□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt2.69□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt2.69□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt2.69□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt2.69□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 YCL019WYCL019W 5313 nt2.69□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 SPO71YDR104C 3738 nt2.69□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 FRE8YLR047C 2061 nt2.69□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 ARP9YMR033W 1404 nt2.68□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 YDL180WYDL180W 1644 nt2.68□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 POL3YDL102W 3294 nt2.68□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 PBS2YJL128C 2007 nt2.68□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 HMF1YER057C 390 nt2.68□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 UPF3YGR072W 1164 nt2.68□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 YGR270C-AYGR270C-A 219 nt2.68□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 POL32YJR043C 1053 nt2.68□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 RPL17AYKL180W 555 nt2.68□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 NEJ1YLR265C 1029 nt2.68□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 VMA6YLR447C 1038 nt2.68□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 SUB1YMR039C 879 nt2.68□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 RIM9YMR063W 720 nt2.68□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 SSU72YNL222W 621 nt2.68□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 snR44snR44 211 nt2.68□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 ATP22YDR350C 2055 nt2.68□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 TLC1TLC1 1301 nt2.68□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 JJJ1YNL227C 1773 nt2.67□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 AI3Q0060 1248 nt2.67□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 YGL082WYGL082W 1146 nt2.67□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 CUP1-1YHR053C 186 nt2.67□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 CUP1-2YHR055C 186 nt2.67□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 FRE2YKL220C 2136 nt2.67□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 RPL6AYML073C 531 nt2.67□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 RSN1YMR266W 2862 nt2.67□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 AI2Q0055 2565 nt2.67□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 PSY2YNL201C 2577 nt2.67□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 TSC11YER093C 4293 nt2.67□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 YNL011CYNL011C 1335 nt2.67□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 FLO5YHR211W 3228 nt2.66□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 PEX5YDR244W 1839 nt2.66□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 SNT1YCR033W 3681 nt2.66□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 HMO1YDR174W 741 nt2.66□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 RGI1YER067W 486 nt2.66□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 YGL218WYGL218W 651 nt2.66□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 YHL005CYHL005C 393 nt2.66□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 YHR182C-AYHR182C-A 474 nt2.66□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt2.66□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 COX14YML129C 213 nt2.66□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 INP1YMR204C 1263 nt2.66□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 RPL20AYMR242C 519 nt2.66□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 YNL043CYNL043C 321 nt2.66□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 YBL065WYBL065W 345 nt2.66□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 GCD2YGR083C 1956 nt2.66□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 PRP8YHR165C 7242 nt2.66□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 PEX6YNL329C 3093 nt2.66□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 CHS2YBR038W 2892 nt2.66□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 SLS1YLR139C 1932 nt2.66□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 DSE1YER124C 1722 nt2.65□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt2.65□□□□□ -1.98
PRP46Q12417 YGL159WYGL159W 1113 nt2.65□□□□□ -1.99
PRP46Q12417 YGL204CYGL204C 306 nt2.65□□□□□ -1.99
PRP46Q12417 PSF2YJL072C 642 nt2.65□□□□□ -1.99
PRP46Q12417 VPS25YJR102C 609 nt2.65□□□□□ -1.99
PRP46Q12417 NNF1YJR112W 606 nt2.65□□□□□ -1.99
PRP46Q12417 CMC1YKL137W 336 nt2.65□□□□□ -1.99
PRP46Q12417 REC102YLR329W 795 nt2.65□□□□□ -1.99
PRP46Q12417 TSR4YOL022C 1227 nt2.65□□□□□ -1.99
PRP46Q12417 PEX15YOL044W 1152 nt2.65□□□□□ -1.99
PRP46Q12417 APA1YCL050C 966 nt2.65□□□□□ -1.99
PRP46Q12417 PEX34YCL056C 435 nt2.65□□□□□ -1.99
PRP46Q12417 MAK11YKL021C 1407 nt2.65□□□□□ -1.99
PRP46Q12417 YBR259WYBR259W 2067 nt2.65□□□□□ -1.99
PRP46Q12417 MSH4YFL003C 2637 nt2.65□□□□□ -1.99
PRP46Q12417 ART10YLR392C 1557 nt2.65□□□□□ -1.99
PRP46Q12417 KRE2YDR483W 1329 nt2.65□□□□□ -1.99
PRP46Q12417 RGR1YLR071C 3249 nt2.64□□□□□ -1.99
PRP46Q12417 NMD2YHR077C 3270 nt2.64□□□□□ -1.99
PRP46Q12417 AI4Q0065 1671 nt2.64□□□□□ -1.99
PRP46Q12417 ERP3YDL018C 678 nt2.64□□□□□ -1.99
PRP46Q12417 RPL13AYDL082W 600 nt2.64□□□□□ -1.99
PRP46Q12417 DIG2YDR480W 972 nt2.64□□□□□ -1.99
PRP46Q12417 MEI4YER044C-A 1227 nt2.64□□□□□ -1.99
PRP46Q12417 AST2YER101C 1293 nt2.64□□□□□ -1.99
PRP46Q12417 YGR111WYGR111W 1203 nt2.64□□□□□ -1.99
PRP46Q12417 YIL175WYIL175W 318 nt2.64□□□□□ -1.99
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