Protein–RNA interactions for Protein: Q12229

UBX3, UBX domain-containing protein 3, yeastyeast

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBX3Q12229 RRG8YPR116W 834 nt3.46□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 KAR4YCL055W 1008 nt3.46□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 FRE4YNR060W 2160 nt3.46□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 RIM4YHL024W 2142 nt3.46□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 BYE1YKL005C 1785 nt3.46□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 FMP25YLR077W 1752 nt3.46□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 GPI10YGL142C 1851 nt3.45□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 MIP6YHR015W 1980 nt3.45□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 YDL199CYDL199C 2064 nt3.45□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 RPS8BYER102W 603 nt3.45□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 THG1YGR024C 714 nt3.45□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 YGR045CYGR045C 363 nt3.45□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 MAK16YAL025C 921 nt3.45□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 ILM1YJR118C 612 nt3.45□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 YLR257WYLR257W 966 nt3.45□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 RPS8AYBL072C 603 nt3.45□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 FYV5YCL058C 459 nt3.45□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 MRH4YGL064C 1686 nt3.45□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 ETP1YHL010C 1758 nt3.45□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 ESA1YOR244W 1338 nt3.44□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 CCM1YGR150C 2595 nt3.44□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 CHK1YBR274W 1584 nt3.44□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 YER084W-AYER084W-A 513 nt3.44□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 SUP56tL(CAA)A 82 nt3.44□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 SUP53tL(CAA)C 82 nt3.44□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt3.44□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt3.44□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 SUP54tL(CAA)G2 82 nt3.44□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt3.44□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt3.44□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt3.44□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt3.44□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt3.44□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 MTC3YGL226W 372 nt3.44□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 YHC1YLR298C 696 nt3.44□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 YPL135C-AYPL135C-A 174 nt3.44□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 CSM4YPL200W 471 nt3.44□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 PIG2YIL045W 1617 nt3.44□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 YDR170W-AYDR170W-A 1323 nt3.44□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 YMR046CYMR046C 1323 nt3.44□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 PPH3YDR075W 927 nt3.43□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 RPA14YDR156W 414 nt3.43□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 YGR190CYGR190C 366 nt3.43□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 YHR213WYHR213W 597 nt3.43□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 YAR062WYAR062W 597 nt3.43□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 UBX4YMR067C 1251 nt3.43□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 IMP1YMR150C 573 nt3.43□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 RFC3YNL290W 1023 nt3.43□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 YPR077CYPR077C 372 nt3.43□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt3.43□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 VPS53YJL029C 2469 nt3.43□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 ARG2YJL071W 1725 nt3.42□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 SKN7YHR206W 1869 nt3.42□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 CLB3YDL155W 1284 nt3.42□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 FIN1YDR130C 876 nt3.42□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 YDR133CYDR133C 336 nt3.42□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 PEA2YER149C 1263 nt3.42□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 YER165C-AYER165C-A 357 nt3.42□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 CGR1YGL029W 363 nt3.42□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt3.42□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 CFD1YIL003W 882 nt3.42□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 YIL024CYIL024C 570 nt3.42□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 YNL324WYNL324W 396 nt3.42□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 DAN4YJR151C 3486 nt3.42□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 FAS1YKL182W 6156 nt3.42□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 SPO23YBR250W 1572 nt3.42□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 COP1YDL145C 3606 nt3.42□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 ABP140YOR239W 1887 nt3.41□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 YJL049WYJL049W 1353 nt3.41□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 STU1YBL034C 4542 nt3.41□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 RPA135YPR010C 3612 nt3.41□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 MGT1YDL200C 567 nt3.41□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 snR9snR9 187 nt3.41□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 YDR157WYDR157W 402 nt3.41□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 YDR381C-AYDR381C-A 345 nt3.41□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 DSE2YHR143W 978 nt3.41□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 YHR182C-AYHR182C-A 474 nt3.41□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 YJR112W-AYJR112W-A 330 nt3.41□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 SDH3YKL141W 597 nt3.41□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 RPL17AYKL180W 555 nt3.41□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt3.41□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 SHH3YMR118C 591 nt3.41□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 INN1YNL152W 1230 nt3.41□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 YNL235CYNL235C 432 nt3.41□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 YRO2YBR054W 1035 nt3.41□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 YPR108W-AYPR108W-A 213 nt3.41□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 CUR1YPR158W 759 nt3.41□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 ATP25YMR098C 1839 nt3.41□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 JJJ1YNL227C 1773 nt3.4□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 TMA64YDR117C 1698 nt3.4□□□□□ -1.86
UBX3Q12229 RPS14AYCR031C 414 nt3.4□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 MIX14YDR031W 366 nt3.4□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 MSM1YGR171C 1728 nt3.4□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt3.4□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 EPT1YHR123W 1176 nt3.4□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt3.4□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt3.4□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 ANB1YJR047C 474 nt3.4□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 MSN1YOL116W 1149 nt3.4□□□□□ -1.87
UBX3Q12229 PEX11YOL147C 711 nt3.4□□□□□ -1.87
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