Protein–RNA interactions for Protein: Q08AE8

SPIRE1, Protein spire homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE1Q08AE8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPIRE1Q08AE8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPIRE1Q08AE8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146 ms