Protein–RNA interactions for Protein: Q05C16

LRRC63, Leucine-rich repeat-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC63Q05C16 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC63Q05C16 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC63Q05C16 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC63Q05C16 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC63Q05C16 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC63Q05C16 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC63Q05C16 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC63Q05C16 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC63Q05C16 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC63Q05C16 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC63Q05C16 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC63Q05C16 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC63Q05C16 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LRRC63Q05C16 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC63Q05C16 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC63Q05C16 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC63Q05C16 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC63Q05C16 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC63Q05C16 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LRRC63Q05C16 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC63Q05C16 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC63Q05C16 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC63Q05C16 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC63Q05C16 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC63Q05C16 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC63Q05C16 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC63Q05C16 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms