Protein–RNA interactions for Protein: P59025

RTP1, Receptor-transporting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP1P59025 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTP1P59025 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RTP1P59025 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTP1P59025 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTP1P59025 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTP1P59025 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTP1P59025 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTP1P59025 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTP1P59025 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTP1P59025 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTP1P59025 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTP1P59025 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTP1P59025 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTP1P59025 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RTP1P59025 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTP1P59025 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTP1P59025 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTP1P59025 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTP1P59025 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTP1P59025 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTP1P59025 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTP1P59025 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTP1P59025 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTP1P59025 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTP1P59025 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RTP1P59025 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTP1P59025 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTP1P59025 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTP1P59025 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTP1P59025 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RTP1P59025 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RTP1P59025 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTP1P59025 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTP1P59025 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTP1P59025 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTP1P59025 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTP1P59025 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTP1P59025 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTP1P59025 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTP1P59025 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTP1P59025 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTP1P59025 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTP1P59025 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTP1P59025 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTP1P59025 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RTP1P59025 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTP1P59025 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTP1P59025 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTP1P59025 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RTP1P59025 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTP1P59025 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTP1P59025 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTP1P59025 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTP1P59025 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTP1P59025 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTP1P59025 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTP1P59025 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTP1P59025 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTP1P59025 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTP1P59025 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RTP1P59025 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTP1P59025 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTP1P59025 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTP1P59025 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTP1P59025 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RTP1P59025 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RTP1P59025 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RTP1P59025 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RTP1P59025 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RTP1P59025 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RTP1P59025 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RTP1P59025 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTP1P59025 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTP1P59025 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTP1P59025 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTP1P59025 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTP1P59025 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTP1P59025 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTP1P59025 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTP1P59025 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTP1P59025 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTP1P59025 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTP1P59025 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTP1P59025 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RTP1P59025 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTP1P59025 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTP1P59025 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTP1P59025 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTP1P59025 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTP1P59025 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTP1P59025 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTP1P59025 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTP1P59025 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTP1P59025 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTP1P59025 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTP1P59025 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RTP1P59025 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTP1P59025 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RTP1P59025 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RTP1P59025 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 256.3 ms