Protein–RNA interactions for Protein: P53618

COPB1, Coatomer subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB1P53618 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPB1P53618 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPB1P53618 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPB1P53618 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPB1P53618 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPB1P53618 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPB1P53618 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPB1P53618 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COPB1P53618 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
COPB1P53618 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23■■□□□ 1.27
COPB1P53618 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COPB1P53618 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COPB1P53618 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COPB1P53618 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
COPB1P53618 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
COPB1P53618 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COPB1P53618 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
COPB1P53618 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
COPB1P53618 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COPB1P53618 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
COPB1P53618 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COPB1P53618 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COPB1P53618 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COPB1P53618 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23■■□□□ 1.27
COPB1P53618 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPB1P53618 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPB1P53618 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPB1P53618 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPB1P53618 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPB1P53618 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPB1P53618 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPB1P53618 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPB1P53618 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPB1P53618 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPB1P53618 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPB1P53618 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPB1P53618 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPB1P53618 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPB1P53618 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPB1P53618 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPB1P53618 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPB1P53618 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
COPB1P53618 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPB1P53618 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPB1P53618 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPB1P53618 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPB1P53618 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPB1P53618 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPB1P53618 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPB1P53618 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPB1P53618 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPB1P53618 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPB1P53618 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPB1P53618 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPB1P53618 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPB1P53618 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPB1P53618 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPB1P53618 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPB1P53618 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPB1P53618 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPB1P53618 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPB1P53618 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPB1P53618 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPB1P53618 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPB1P53618 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPB1P53618 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPB1P53618 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPB1P53618 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPB1P53618 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPB1P53618 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPB1P53618 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPB1P53618 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPB1P53618 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPB1P53618 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPB1P53618 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPB1P53618 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPB1P53618 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
COPB1P53618 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPB1P53618 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPB1P53618 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPB1P53618 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPB1P53618 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPB1P53618 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPB1P53618 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPB1P53618 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPB1P53618 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPB1P53618 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
COPB1P53618 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPB1P53618 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPB1P53618 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPB1P53618 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPB1P53618 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPB1P53618 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPB1P53618 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
COPB1P53618 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPB1P53618 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPB1P53618 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPB1P53618 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPB1P53618 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPB1P53618 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms